RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 NOXA1Q86UR1 476 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 RELL1Q8IUW5 271 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 POLE4Q9NR33 117 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 EXD2Q9NVH0 621 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CD274Q9NZQ7 290 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 GABARAPL2P60520 117 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 PPP2R2BQ00005 443 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 SPESP1Q6UW49 350 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CHPFQ8IZ52 775 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 TNRQ92752 1358 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 MPZL2O60487 215 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CD36P16671 472 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 MYF6P23409 242 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 GALEQ14376 348 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 STARD3Q14849 445 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 EMC2Q15006 297 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CYP20A1Q6UW02 462 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 IRGMA1A4Y4 181 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 MYL9P24844 172 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 RPA4Q13156 261 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ARSKQ6UWY0 536 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 HDAC10Q969S8 669 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 POMKQ9H5K3 350 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 GSAPA4D1B5 854 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 AQP12BA6NM10 295 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 USP17L15C9J2P7 530 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 USP17L11C9JVI0 530 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 USP17L18D6R9N7 530 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 USP17L22D6RA61 530 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 USP17L19D6RCP7 530 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 USP17L20D6RJB6 530 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 S100A2P29034 98 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 TPI1P60174 286 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 USP17L24Q0WX57 530 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 DEF8Q6ZN54 512 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 OR8K5Q8NH50 307 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 HYLS1Q96M11 299 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CHST12Q9NRB3 414 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 TNS3Q68CZ2 1445 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 A0A088AWK7 358 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 SLITRK5O94991 958 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 HOXD13P35453 343 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 HSD17B4P51659 736 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 JAM2P57087 298 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 DCAF6Q58WW2 860 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CASS4Q9NQ75 786 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 RGS18Q9NS28 235 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.373e-6■■■■□ 25.5
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SBNO1-202ENST00000420886 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 FOSL2P15408 326 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 IGFBP5P24593 272 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 DCKP27707 260 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 RDH12Q96NR8 316 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 MIPEPQ99797 713 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.49□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.48□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 FABP12A6NFH5 140 aa6.48□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 REP15Q6BDI9 236 aa6.48□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.48□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.48□□□□□ -1.37
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