RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	YKL069W	P36088	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	JNM1	P36224	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	TOS4	Q06266	489 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	ATG13	Q06628	738 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	NUP145	P49687	1317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	RPB10	P22139	70 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	MPD2	Q99316	277 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	CCP1	P00431	361 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	TEC1	P18412	486 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	MSH2	P25847	964 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	MUM2	P38236	366 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	FAA3	P39002	694 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	UBX4	P54730	416 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	UFD2	P54860	961 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	TFB2	Q02939	513 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	BDS1	Q08347	646 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	RRI2	Q12348	645 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	CDC34	P14682	295 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	GUT2	P32191	649 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	CWH41	P53008	833 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	SPC105	P53148	917 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	YGR035C	P53222	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	FRA1	Q07825	749 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	SSH4	P32343	579 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	ISC10	P32645	267 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	PEA2	P40091	420 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	FIG4	P42837	879 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	YJR098C	P47139	656 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	PMT3	P47190	753 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	TGL2	P54857	326 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	ESC2	Q06340	456 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	CAN1	P04817	590 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	BAS1	P22035	811 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	TRK2	P28584	889 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	YBR184W	P38299	523 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	HSE1	P38753	452 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	YIR007W	P40566	764 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	MRPS18	P42847	217 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	YGR053C	P53234	283 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	COG6	P53959	839 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	SPO75	Q07798	868 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	GRC3	Q07845	632 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
SLX8	YER116C	MKS1	P34072	584 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	EXO84	P38261	753 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	YBR197C	P38306	217 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	NDE1	P40215	560 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	APL6	P46682	809 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	UBA2	P52488	636 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	PEX14	P53112	341 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	YNL034W	P53963	612 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	YNL018C	P53976	612 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	YNL011C	P53980	444 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	CDC55	Q00362	526 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	DAL4	Q04895	635 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	THI73	Q07904	523 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SLX8	YER116C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	NPR1	P22211	790 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	STE5	P32917	917 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	DUT1	P33317	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	PEX6	P33760	1030 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	NTH2	P35172	780 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	PIP2	P52960	996 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	APP1	P53933	587 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	UME1	Q03010	460 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	YPR084W	Q06821	456 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	VPS5	Q92331	675 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	FBP26	P32604	452 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	YBR071W	P38243	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	VTC4	P47075	721 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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