RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639848.1

HLA-B-256, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, human

BASIC

Gene HLA-B, Length 1,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HLA-B-256	ENST00000639848	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
HLA-B-256	ENST00000639848	CRB1	P82279	1406 aa		28.07	■■■□□ 2.08
HLA-B-256	ENST00000639848	COG3	Q96JB2	828 aa		28.06	■■■□□ 2.08
HLA-B-256	ENST00000639848	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		28.06	■■■□□ 2.08
HLA-B-256	ENST00000639848	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		28.06	■■■□□ 2.08
HLA-B-256	ENST00000639848	MYOM1	P52179	1685 aa		28.05	■■■□□ 2.08
HLA-B-256	ENST00000639848	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		28.05	■■■□□ 2.08
HLA-B-256	ENST00000639848	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		28.04	■■■□□ 2.08
HLA-B-256	ENST00000639848	CCDC125	Q86Z20	511 aa		28.04	■■■□□ 2.08
HLA-B-256	ENST00000639848	USP35	Q9P2H5	1018 aa		28.03	■■■□□ 2.08
HLA-B-256	ENST00000639848	FYB1	O15117	783 aa		28.02	■■■□□ 2.08
HLA-B-256	ENST00000639848	EP400	Q96L91	3159 aa		28.02	■■■□□ 2.08
HLA-B-256	ENST00000639848	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		28.01	■■■□□ 2.07
HLA-B-256	ENST00000639848	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		27.99	■■■□□ 2.07
HLA-B-256	ENST00000639848	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		27.99	■■■□□ 2.07
HLA-B-256	ENST00000639848	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		27.98	■■■□□ 2.07
HLA-B-256	ENST00000639848	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
HLA-B-256	ENST00000639848	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		27.96	■■■□□ 2.07
HLA-B-256	ENST00000639848	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		27.96	■■■□□ 2.07
HLA-B-256	ENST00000639848	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		27.95	■■■□□ 2.06
HLA-B-256	ENST00000639848	ERBB3	P21860	1342 aa		27.94	■■■□□ 2.06
HLA-B-256	ENST00000639848	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		27.94	■■■□□ 2.06
HLA-B-256	ENST00000639848	IP6K1	Q92551	441 aa		27.93	■■■□□ 2.06
HLA-B-256	ENST00000639848	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
HLA-B-256	ENST00000639848	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		27.92	■■■□□ 2.06
HLA-B-256	ENST00000639848	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		27.92	■■■□□ 2.06
HLA-B-256	ENST00000639848	LTN1	O94822	1766 aa		27.91	■■■□□ 2.06
HLA-B-256	ENST00000639848	CCDC7	Q96M83	1385 aa		27.91	■■■□□ 2.06
HLA-B-256	ENST00000639848	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
HLA-B-256	ENST00000639848	RTL1	A6NKG5	1358 aa		27.89	■■■□□ 2.06
HLA-B-256	ENST00000639848	PDE3B	Q13370	1112 aa		27.89	■■■□□ 2.06
HLA-B-256	ENST00000639848	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		27.88	■■■□□ 2.05
HLA-B-256	ENST00000639848	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		27.88	■■■□□ 2.05
HLA-B-256	ENST00000639848	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
HLA-B-256	ENST00000639848	RGPD5	Q99666	1765 aa		27.88	■■■□□ 2.05
HLA-B-256	ENST00000639848	AMPH	P49418	695 aa		27.87	■■■□□ 2.05
HLA-B-256	ENST00000639848	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
HLA-B-256	ENST00000639848	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		27.87	■■■□□ 2.05
HLA-B-256	ENST00000639848	HOXC9	P31274	260 aa		27.86	■■■□□ 2.05
HLA-B-256	ENST00000639848	DISP2	A7MBM2	1401 aa		27.85	■■■□□ 2.05
HLA-B-256	ENST00000639848	FAM182B	Q5T319	152 aa		27.85	■■■□□ 2.05
HLA-B-256	ENST00000639848	PANK3	Q9H999	370 aa		27.85	■■■□□ 2.05
HLA-B-256	ENST00000639848	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		27.85	■■■□□ 2.05
HLA-B-256	ENST00000639848	FBLN1	P23142	703 aa		27.84	■■■□□ 2.05
HLA-B-256	ENST00000639848	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		27.84	■■■□□ 2.05
HLA-B-256	ENST00000639848	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		27.84	■■■□□ 2.05
HLA-B-256	ENST00000639848	DDB1	Q16531	1140 aa		27.83	■■■□□ 2.05
HLA-B-256	ENST00000639848	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
HLA-B-256	ENST00000639848	LRRC37A3	O60309	1634 aa		27.8	■■■□□ 2.04
HLA-B-256	ENST00000639848	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		27.79	■■■□□ 2.04
HLA-B-256	ENST00000639848	NSD2	O96028	1365 aa		27.79	■■■□□ 2.04
HLA-B-256	ENST00000639848	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		27.78	■■■□□ 2.04
HLA-B-256	ENST00000639848	FLT4	P35916	1363 aa		27.78	■■■□□ 2.04
HLA-B-256	ENST00000639848	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
HLA-B-256	ENST00000639848	BAG6	P46379	1132 aa		27.77	■■■□□ 2.04
HLA-B-256	ENST00000639848	INSR	P06213	1382 aa		27.76	■■■□□ 2.03
HLA-B-256	ENST00000639848	IL2RB	P14784	551 aa		27.76	■■■□□ 2.03
HLA-B-256	ENST00000639848	EXOC5	O00471	708 aa		27.75	■■■□□ 2.03
HLA-B-256	ENST00000639848	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
HLA-B-256	ENST00000639848	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		27.75	■■■□□ 2.03
HLA-B-256	ENST00000639848	TNS2	Q63HR2	1409 aa		27.75	■■■□□ 2.03
HLA-B-256	ENST00000639848	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
HLA-B-256	ENST00000639848	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		27.74	■■■□□ 2.03
HLA-B-256	ENST00000639848	BCL9	O00512	1426 aa		27.74	■■■□□ 2.03
HLA-B-256	ENST00000639848	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		27.73	■■■□□ 2.03
HLA-B-256	ENST00000639848	TRIM37	O94972	964 aa		27.72	■■■□□ 2.03
HLA-B-256	ENST00000639848	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		27.71	■■■□□ 2.03
HLA-B-256	ENST00000639848	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
HLA-B-256	ENST00000639848	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		27.71	■■■□□ 2.03
HLA-B-256	ENST00000639848	PEAK1	Q9H792	1746 aa		27.7	■■■□□ 2.03
HLA-B-256	ENST00000639848	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		27.7	■■■□□ 2.02
HLA-B-256	ENST00000639848	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
HLA-B-256	ENST00000639848	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		27.67	■■■□□ 2.02
HLA-B-256	ENST00000639848	POLK	Q9UBT6	870 aa		27.67	■■■□□ 2.02
HLA-B-256	ENST00000639848	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		27.65	■■■□□ 2.02
HLA-B-256	ENST00000639848	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		27.65	■■■□□ 2.02
HLA-B-256	ENST00000639848	NBPF4	Q96M43	638 aa		27.65	■■■□□ 2.02
HLA-B-256	ENST00000639848	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
HLA-B-256	ENST00000639848	APBA3	O96018	575 aa		27.64	■■■□□ 2.02
HLA-B-256	ENST00000639848	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
HLA-B-256	ENST00000639848	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
HLA-B-256	ENST00000639848	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
HLA-B-256	ENST00000639848	MORC1	Q86VD1	984 aa		27.63	■■■□□ 2.01
HLA-B-256	ENST00000639848	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
HLA-B-256	ENST00000639848	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		27.61	■■■□□ 2.01
HLA-B-256	ENST00000639848	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
HLA-B-256	ENST00000639848	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		27.59	■■■□□ 2.01
HLA-B-256	ENST00000639848	MEGF6	O75095	1541 aa		27.58	■■■□□ 2.01
HLA-B-256	ENST00000639848	NCAPD2	Q15021	1401 aa		27.58	■■■□□ 2
HLA-B-256	ENST00000639848	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
HLA-B-256	ENST00000639848	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		27.57	■■■□□ 2
HLA-B-256	ENST00000639848	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		27.57	■■■□□ 2
HLA-B-256	ENST00000639848	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
HLA-B-256	ENST00000639848	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		27.55	■■■□□ 2
HLA-B-256	ENST00000639848	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
HLA-B-256	ENST00000639848	PLSCR1	O15162	318 aa		27.55	■■■□□ 2
HLA-B-256	ENST00000639848	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
HLA-B-256	ENST00000639848	SBF2	Q86WG5	1849 aa		27.54	■■■□□ 2
HLA-B-256	ENST00000639848	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
HLA-B-256	ENST00000639848	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2

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