RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589686.5

CIRBP-224, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 2

Gene CIRBP, Length 532 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-224	ENST00000589686	COL18A1	P39060	1754 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CIRBP-224	ENST00000589686	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CIRBP-224	ENST00000589686	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		29.3	■■■□□ 2.28
CIRBP-224	ENST00000589686	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	29.3	■■■□□ 2.28
CIRBP-224	ENST00000589686	CRB1	P82279	1406 aa		29.28	■■■□□ 2.28
CIRBP-224	ENST00000589686	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		29.27	■■■□□ 2.28
CIRBP-224	ENST00000589686	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		29.27	■■■□□ 2.28
CIRBP-224	ENST00000589686	ABCC6	O95255	1503 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CIRBP-224	ENST00000589686	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CIRBP-224	ENST00000589686	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
CIRBP-224	ENST00000589686	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CIRBP-224	ENST00000589686	COG3	Q96JB2	828 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CIRBP-224	ENST00000589686	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
CIRBP-224	ENST00000589686	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		29.21	■■■□□ 2.27
CIRBP-224	ENST00000589686	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
CIRBP-224	ENST00000589686	RGPD5	Q99666	1765 aa		29.18	■■■□□ 2.26
CIRBP-224	ENST00000589686	FYB1	O15117	783 aa		29.18	■■■□□ 2.26
CIRBP-224	ENST00000589686	PDE3B	Q13370	1112 aa		29.18	■■■□□ 2.26
CIRBP-224	ENST00000589686	MYOM1	P52179	1685 aa		29.18	■■■□□ 2.26
CIRBP-224	ENST00000589686	FAM182B	Q5T319	152 aa		29.17	■■■□□ 2.26
CIRBP-224	ENST00000589686	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		29.17	■■■□□ 2.26
CIRBP-224	ENST00000589686	LTN1	O94822	1766 aa		29.16	■■■□□ 2.26
CIRBP-224	ENST00000589686	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		29.15	■■■□□ 2.26
CIRBP-224	ENST00000589686	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		29.15	■■■□□ 2.26
CIRBP-224	ENST00000589686	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		29.15	■■■□□ 2.26
CIRBP-224	ENST00000589686	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		29.14	■■■□□ 2.26
CIRBP-224	ENST00000589686	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
CIRBP-224	ENST00000589686	ERBB3	P21860	1342 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CIRBP-224	ENST00000589686	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
CIRBP-224	ENST00000589686	IP6K1	Q92551	441 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CIRBP-224	ENST00000589686	CCDC7	Q96M83	1385 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CIRBP-224	ENST00000589686	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CIRBP-224	ENST00000589686	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CIRBP-224	ENST00000589686	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-224	ENST00000589686	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-224	ENST00000589686	DDB1	Q16531	1140 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CIRBP-224	ENST00000589686	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CIRBP-224	ENST00000589686	FBLN1	P23142	703 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-224	ENST00000589686	BAG6	P46379	1132 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-224	ENST00000589686	AMPH	P49418	695 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-224	ENST00000589686	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-224	ENST00000589686	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
CIRBP-224	ENST00000589686	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CIRBP-224	ENST00000589686	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CIRBP-224	ENST00000589686	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-224	ENST00000589686	HOXC9	P31274	260 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-224	ENST00000589686	DISP2	A7MBM2	1401 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CIRBP-224	ENST00000589686	LRRC37A3	O60309	1634 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CIRBP-224	ENST00000589686	TRIM37	O94972	964 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CIRBP-224	ENST00000589686	RTL1	A6NKG5	1358 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CIRBP-224	ENST00000589686	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
CIRBP-224	ENST00000589686	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
CIRBP-224	ENST00000589686	EXOC5	O00471	708 aa		29	■■■□□ 2.23
CIRBP-224	ENST00000589686	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		29	■■■□□ 2.23
CIRBP-224	ENST00000589686	PANK3	Q9H999	370 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CIRBP-224	ENST00000589686	IL2RB	P14784	551 aa		28.97	■■■□□ 2.23
CIRBP-224	ENST00000589686	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
CIRBP-224	ENST00000589686	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
CIRBP-224	ENST00000589686	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
CIRBP-224	ENST00000589686	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
CIRBP-224	ENST00000589686	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		28.96	■■■□□ 2.23
CIRBP-224	ENST00000589686	APBA3	O96018	575 aa		28.94	■■■□□ 2.22
CIRBP-224	ENST00000589686	PEAK1	Q9H792	1746 aa		28.94	■■■□□ 2.22
CIRBP-224	ENST00000589686	TNS2	Q63HR2	1409 aa		28.93	■■■□□ 2.22
CIRBP-224	ENST00000589686	FLT4	P35916	1363 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CIRBP-224	ENST00000589686	BCL9	O00512	1426 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CIRBP-224	ENST00000589686	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CIRBP-224	ENST00000589686	INSR	P06213	1382 aa		28.91	■■■□□ 2.22
CIRBP-224	ENST00000589686	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
CIRBP-224	ENST00000589686	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CIRBP-224	ENST00000589686	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CIRBP-224	ENST00000589686	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CIRBP-224	ENST00000589686	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CIRBP-224	ENST00000589686	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
CIRBP-224	ENST00000589686	NSD2	O96028	1365 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CIRBP-224	ENST00000589686	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
CIRBP-224	ENST00000589686	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
CIRBP-224	ENST00000589686	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CIRBP-224	ENST00000589686	NBPF4	Q96M43	638 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CIRBP-224	ENST00000589686	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CIRBP-224	ENST00000589686	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CIRBP-224	ENST00000589686	SBF2	Q86WG5	1849 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CIRBP-224	ENST00000589686	POLK	Q9UBT6	870 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CIRBP-224	ENST00000589686	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CIRBP-224	ENST00000589686	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CIRBP-224	ENST00000589686	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
CIRBP-224	ENST00000589686	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
CIRBP-224	ENST00000589686	PLSCR1	O15162	318 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CIRBP-224	ENST00000589686	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CIRBP-224	ENST00000589686	MORC1	Q86VD1	984 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CIRBP-224	ENST00000589686	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CIRBP-224	ENST00000589686	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CIRBP-224	ENST00000589686	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
CIRBP-224	ENST00000589686	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
CIRBP-224	ENST00000589686	MEGF6	O75095	1541 aa		28.76	■■■□□ 2.19
CIRBP-224	ENST00000589686	KCNQ2	O43526	872 aa		28.73	■■■□□ 2.19
CIRBP-224	ENST00000589686	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
CIRBP-224	ENST00000589686	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
CIRBP-224	ENST00000589686	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		28.73	■■■□□ 2.19
CIRBP-224	ENST00000589686	RREB1	Q92766	1687 aa		28.73	■■■□□ 2.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms