RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PSME3-209	ENST00000589469	COL18A1	P39060	1754 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PSME3-209	ENST00000589469	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PSME3-209	ENST00000589469	CRB1	P82279	1406 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PSME3-209	ENST00000589469	ABCC6	O95255	1503 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PSME3-209	ENST00000589469	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PSME3-209	ENST00000589469	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PSME3-209	ENST00000589469	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PSME3-209	ENST00000589469	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PSME3-209	ENST00000589469	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PSME3-209	ENST00000589469	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PSME3-209	ENST00000589469	FYB1	O15117	783 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PSME3-209	ENST00000589469	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PSME3-209	ENST00000589469	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PSME3-209	ENST00000589469	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PSME3-209	ENST00000589469	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		27.76	■■■□□ 2.04
PSME3-209	ENST00000589469	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PSME3-209	ENST00000589469	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC125	Q86Z20	511 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PSME3-209	ENST00000589469	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	LTN1	O94822	1766 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	ERBB3	P21860	1342 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	IP6K1	Q92551	441 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	PDE3B	Q13370	1112 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	RGPD5	Q99666	1765 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC7	Q96M83	1385 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	FBLN1	P23142	703 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	AMPH	P49418	695 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	FAM182B	Q5T319	152 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	PANK3	Q9H999	370 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	RTL1	A6NKG5	1358 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PSME3-209	ENST00000589469	HOXC9	P31274	260 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PSME3-209	ENST00000589469	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PSME3-209	ENST00000589469	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PSME3-209	ENST00000589469	EP400	Q96L91	3159 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PSME3-209	ENST00000589469	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PSME3-209	ENST00000589469	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PSME3-209	ENST00000589469	DDB1	Q16531	1140 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PSME3-209	ENST00000589469	DISP2	A7MBM2	1401 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PSME3-209	ENST00000589469	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PSME3-209	ENST00000589469	LRRC37A3	O60309	1634 aa		27.57	■■■□□ 2
PSME3-209	ENST00000589469	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		27.56	■■■□□ 2
PSME3-209	ENST00000589469	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		27.55	■■■□□ 2
PSME3-209	ENST00000589469	FLT4	P35916	1363 aa		27.55	■■■□□ 2
PSME3-209	ENST00000589469	NSD2	O96028	1365 aa		27.54	■■■□□ 2
PSME3-209	ENST00000589469	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		27.53	■■■□□ 2
PSME3-209	ENST00000589469	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
PSME3-209	ENST00000589469	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		27.52	■■■□□ 2
PSME3-209	ENST00000589469	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
PSME3-209	ENST00000589469	IL2RB	P14784	551 aa		27.52	■■■□□ 2
PSME3-209	ENST00000589469	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		27.52	■■■□□ 2
PSME3-209	ENST00000589469	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		27.52	■■■□□ 2
PSME3-209	ENST00000589469	INSR	P06213	1382 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PSME3-209	ENST00000589469	EXOC5	O00471	708 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PSME3-209	ENST00000589469	BAG6	P46379	1132 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PSME3-209	ENST00000589469	TRIM37	O94972	964 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PSME3-209	ENST00000589469	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PSME3-209	ENST00000589469	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PSME3-209	ENST00000589469	TNS2	Q63HR2	1409 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PSME3-209	ENST00000589469	PEAK1	Q9H792	1746 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PSME3-209	ENST00000589469	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PSME3-209	ENST00000589469	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PSME3-209	ENST00000589469	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
PSME3-209	ENST00000589469	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
PSME3-209	ENST00000589469	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
PSME3-209	ENST00000589469	MORC1	Q86VD1	984 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PSME3-209	ENST00000589469	POLK	Q9UBT6	870 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PSME3-209	ENST00000589469	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PSME3-209	ENST00000589469	NBPF4	Q96M43	638 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PSME3-209	ENST00000589469	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	27.43	■■□□□ 1.98
PSME3-209	ENST00000589469	BCL9	O00512	1426 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PSME3-209	ENST00000589469	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	27.42	■■□□□ 1.98
PSME3-209	ENST00000589469	APBA3	O96018	575 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PSME3-209	ENST00000589469	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	27.41	■■□□□ 1.98
PSME3-209	ENST00000589469	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PSME3-209	ENST00000589469	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	27.39	■■□□□ 1.98
PSME3-209	ENST00000589469	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		27.39	■■□□□ 1.97
PSME3-209	ENST00000589469	MEGF6	O75095	1541 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PSME3-209	ENST00000589469	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PSME3-209	ENST00000589469	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PSME3-209	ENST00000589469	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	27.35	■■□□□ 1.97
PSME3-209	ENST00000589469	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PSME3-209	ENST00000589469	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	27.34	■■□□□ 1.97
PSME3-209	ENST00000589469	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PSME3-209	ENST00000589469	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	27.34	■■□□□ 1.97
PSME3-209	ENST00000589469	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	27.33	■■□□□ 1.97
PSME3-209	ENST00000589469	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	27.33	■■□□□ 1.97
PSME3-209	ENST00000589469	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	27.32	■■□□□ 1.96
PSME3-209	ENST00000589469	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	27.31	■■□□□ 1.96
PSME3-209	ENST00000589469	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	27.31	■■□□□ 1.96
PSME3-209	ENST00000589469	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		27.3	■■□□□ 1.96
PSME3-209	ENST00000589469	NCAPD2	Q15021	1401 aa		27.3	■■□□□ 1.96

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