RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 IP6K1Q92551 441 aa26.02■■□□□ 1.76
PGS1-211ENST00000589425 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.02■■□□□ 1.76
PGS1-211ENST00000589425 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PGS1-211ENST00000589425 ZNF521Q96K83 1311 aa26.02■■□□□ 1.76
PGS1-211ENST00000589425 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.02■■□□□ 1.76
PGS1-211ENST00000589425 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.02■■□□□ 1.76
PGS1-211ENST00000589425 RTL1A6NKG5 1358 aa26.01■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 PRKAR2BP31323 418 aa26■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 NEUROD2Q15784 382 aa26■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 NGEFQ8N5V2 710 aa26■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 CDCA7LQ96GN5 454 aa26■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 PDE3BQ13370 1112 aa25.99■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.99■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.98■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.98■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.97■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.97■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.97■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 EYA1Q99502 592 aa25.96■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PGS1-211ENST00000589425 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PGS1-211ENST00000589425 WWC1Q8IX03 1113 aa25.95■■□□□ 1.74
PGS1-211ENST00000589425 TOM1O60784 492 aa25.94■■□□□ 1.74
PGS1-211ENST00000589425 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PGS1-211ENST00000589425 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.94■■□□□ 1.74
PGS1-211ENST00000589425 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.94■■□□□ 1.74
PGS1-211ENST00000589425 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PGS1-211ENST00000589425 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.93■■□□□ 1.74
PGS1-211ENST00000589425 GOLGA2Q08379 1002 aa25.92■■□□□ 1.74
PGS1-211ENST00000589425 CCDC27Q2M243 656 aa25.92■■□□□ 1.74
PGS1-211ENST00000589425 NEFMP07197 916 aa25.91■■□□□ 1.74
PGS1-211ENST00000589425 PIP4K2BP78356 416 aa25.9■■□□□ 1.74
PGS1-211ENST00000589425 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PGS1-211ENST00000589425 RIPK4P57078 832 aa25.89■■□□□ 1.74
PGS1-211ENST00000589425 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PGS1-211ENST00000589425 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
PGS1-211ENST00000589425 KDRP35968 1356 aa25.89■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.88■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.87■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 KIAA0232Q92628 1395 aa25.87■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 SLFN5Q08AF3 891 aa25.86■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 CHRNA2Q15822 529 aa25.86■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 NFE2L2Q16236 605 aa25.86■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.86■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.86■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 NBPF4Q96M43 638 aa25.86■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 CPDO75976 1380 aa25.86■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.84■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.84■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.84■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 WDR63Q8IWG1 891 aa25.84■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 COL18A1P39060 1754 aa25.83■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 CERKQ8TCT0 537 aa25.83■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 RGPD5Q99666 1765 aa25.83■■□□□ 1.73
PGS1-211ENST00000589425 ERBB3P21860 1342 aa25.81■■□□□ 1.72
PGS1-211ENST00000589425 E9PSI1 815 aa25.81■■□□□ 1.72
PGS1-211ENST00000589425 ABCA3Q99758 1704 aa25.8■■□□□ 1.72
PGS1-211ENST00000589425 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.8■■□□□ 1.72
PGS1-211ENST00000589425 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.8■■□□□ 1.72
PGS1-211ENST00000589425 PHLPP1O60346 1717 aa25.78■■□□□ 1.72
PGS1-211ENST00000589425 ABCC6O95255 1503 aa25.77■■□□□ 1.72
PGS1-211ENST00000589425 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PGS1-211ENST00000589425 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.72
PGS1-211ENST00000589425 NCAPD2Q15021 1401 aa25.74■■□□□ 1.71
PGS1-211ENST00000589425 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.74■■□□□ 1.71
PGS1-211ENST00000589425 FAM83GA6ND36 823 aa25.74■■□□□ 1.71
PGS1-211ENST00000589425 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PGS1-211ENST00000589425 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PGS1-211ENST00000589425 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.72■■□□□ 1.71
PGS1-211ENST00000589425 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.72■■□□□ 1.71
PGS1-211ENST00000589425 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.71■■□□□ 1.71
PGS1-211ENST00000589425 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.71■■□□□ 1.71
PGS1-211ENST00000589425 DCTN1Q14203 1278 aa25.71■■□□□ 1.71
PGS1-211ENST00000589425 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.71■■□□□ 1.71
PGS1-211ENST00000589425 IL16Q14005 1332 aa25.71■■□□□ 1.71
PGS1-211ENST00000589425 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.7■■□□□ 1.71
PGS1-211ENST00000589425 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.7■■□□□ 1.7
PGS1-211ENST00000589425 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.69■■□□□ 1.7
PGS1-211ENST00000589425 MCM10Q7L590 875 aa25.67■■□□□ 1.7
PGS1-211ENST00000589425 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
PGS1-211ENST00000589425 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
PGS1-211ENST00000589425 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.65■■□□□ 1.7
PGS1-211ENST00000589425 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.65■■□□□ 1.7
PGS1-211ENST00000589425 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.65■■□□□ 1.7
PGS1-211ENST00000589425 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
PGS1-211ENST00000589425 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PGS1-211ENST00000589425 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PGS1-211ENST00000589425 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PGS1-211ENST00000589425 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.62■■□□□ 1.69
PGS1-211ENST00000589425 ZNF853P0CG23 659 aa25.62■■□□□ 1.69
PGS1-211ENST00000589425 FKBP8Q14318 412 aa25.62■■□□□ 1.69
PGS1-211ENST00000589425 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.62■■□□□ 1.69
PGS1-211ENST00000589425 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PGS1-211ENST00000589425 STRN4Q9NRL3 753 aa25.62■■□□□ 1.69
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