RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 FCHSD2O94868 740 aa41.1■■■■■ 4.17
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF25Q86VW2 580 aa41.1■■■■■ 4.17
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
CAPNS1-206ENST00000588815 IP6K1Q92551 441 aa41.09■■■■■ 4.17
CAPNS1-206ENST00000588815 PHLPP1O60346 1717 aa41.09■■■■■ 4.17
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC146Q8IYE0 955 aa41.06■■■■■ 4.16
CAPNS1-206ENST00000588815 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
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CAPNS1-206ENST00000588815 COL18A1P39060 1754 aa41.02■■■■■ 4.16
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CAPNS1-206ENST00000588815 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.15
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CAPNS1-206ENST00000588815 CERKQ8TCT0 537 aa41■■■■■ 4.15
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CAPNS1-206ENST00000588815 PDE3BQ13370 1112 aa40.98■■■■■ 4.15
CAPNS1-206ENST00000588815 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.97■■■■■ 4.15
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CAPNS1-206ENST00000588815 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa40.97■■■■■ 4.15
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CAPNS1-206ENST00000588815 KDRP35968 1356 aa40.92■■■■■ 4.14
CAPNS1-206ENST00000588815 RGPD2P0DJD1 1756 aa40.91■■■■■ 4.14
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF521Q96K83 1311 aa40.88■■■■■ 4.14
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB7CA1YPR0 619 aa40.88■■■■■ 4.13
CAPNS1-206ENST00000588815 PIP4K2BP78356 416 aa40.87■■■■■ 4.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SULT6B1Q6IMI4 303 aa40.87■■■■■ 4.13
CAPNS1-206ENST00000588815 EYA1Q99502 592 aa40.87■■■■■ 4.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
CAPNS1-206ENST00000588815 DLG5Q8TDM6 1919 aa40.87■■■■■ 4.13
CAPNS1-206ENST00000588815 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
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CAPNS1-206ENST00000588815 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa40.83■■■■■ 4.13
CAPNS1-206ENST00000588815 LMO7Q8WWI1 1683 aa40.83■■■■■ 4.13
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CAPNS1-206ENST00000588815 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.12
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CAPNS1-206ENST00000588815 NCAPD2Q15021 1401 aa40.8■■■■■ 4.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD24Q8TF21 1146 aa40.78■■■■■ 4.12
CAPNS1-206ENST00000588815 AXIN2Q9Y2T1 843 aa40.78■■■■■ 4.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ERBB3P21860 1342 aa40.78■■■■■ 4.12
CAPNS1-206ENST00000588815 AEBP1Q8IUX7 1158 aa40.77■■■■■ 4.12
CAPNS1-206ENST00000588815 PRDM11Q9NQV5 511 aa40.77■■■■■ 4.12
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA2Q08379 1002 aa40.76■■■■■ 4.12
CAPNS1-206ENST00000588815 WWC1Q8IX03 1113 aa40.76■■■■■ 4.12
CAPNS1-206ENST00000588815 NFE2L2Q16236 605 aa40.75■■■■■ 4.11
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CAPNS1-206ENST00000588815 WDR63Q8IWG1 891 aa40.72■■■■■ 4.11
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CAPNS1-206ENST00000588815 NBPF6Q5VWK0 638 aa40.7■■■■■ 4.11
CAPNS1-206ENST00000588815 NBPF4Q96M43 638 aa40.7■■■■■ 4.11
CAPNS1-206ENST00000588815 CHRNA2Q15822 529 aa40.69■■■■■ 4.1
CAPNS1-206ENST00000588815 LMOD3Q0VAK6 560 aa40.68■■■■■ 4.1
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa40.65■■■■■ 4.1
CAPNS1-206ENST00000588815 E9PSI1 815 aa40.64■■■■■ 4.1
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM35Q9UPQ4 493 aa40.64■■■■■ 4.1
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CAPNS1-206ENST00000588815 CDCA7LQ96GN5 454 aa40.63■■■■■ 4.09
CAPNS1-206ENST00000588815 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
CAPNS1-206ENST00000588815 GAS2L2Q8NHY3 880 aa40.62■■■■■ 4.09
CAPNS1-206ENST00000588815 IL16Q14005 1332 aa40.6■■■■■ 4.09
CAPNS1-206ENST00000588815 JCADQ9P266 1359 aa40.6■■■■■ 4.09
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CAPNS1-206ENST00000588815 MYH16Q9H6N6 1097 aa40.5■■■■■ 4.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PKD1L3Q7Z443 1732 aa40.47■■■■■ 4.07
CAPNS1-206ENST00000588815 NRAPQ86VF7 1730 aa40.46■■■■■ 4.07
CAPNS1-206ENST00000588815 EVA1CP58658 441 aa40.45■■■■■ 4.07
CAPNS1-206ENST00000588815 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa40.45■■■■■ 4.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa40.45■■■■■ 4.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa40.44■■■■■ 4.06
CAPNS1-206ENST00000588815 CARD10Q9BWT7 1032 aa40.44■■■■■ 4.06
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