RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF7Q2M1P5 1343 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 SLIT3O75094 1523 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 USP35Q9P2H5 1018 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 NRAPQ86VF7 1730 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 CPDO75976 1380 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 LTN1O94822 1766 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0G2JS52 829 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 MYT1Q01538 1121 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 COL18A1P39060 1754 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 GLI3P10071 1580 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 USP54Q70EL1 1684 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 BRWD3Q6RI45 1802 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 AMPHP49418 695 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 LMO7Q8WWI1 1683 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 CGNL1Q0VF96 1302 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 RGS12O14924 1447 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 KNSTRNQ9Y448 316 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 NFAT5O94916 1531 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 IP6K1Q92551 441 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC7Q96M83 1385 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP3K19Q56UN5 1328 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD24Q8TF21 1146 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR17Q8IZU2 1322 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 HOXC9P31274 260 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM182BQ5T319 152 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 MORC1Q86VD1 984 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 CRB1P82279 1406 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 RGPD2P0DJD1 1756 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 BARGINQ6ZT62 677 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 PDE3BQ13370 1112 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 POLKQ9UBT6 870 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 ERBB3P21860 1342 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-211ENST00000588374 EXOC5O00471 708 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 DDB1Q16531 1140 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 PEAK1Q9H792 1746 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 USHBP1Q8N6Y0 703 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 NBPF4Q96M43 638 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCC6O95255 1503 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 NSD2O96028 1365 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 INSRP06213 1382 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 IL2RBP14784 551 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 FLT4P35916 1363 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 WNK3Q9BYP7 1800 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 MTHFSP49914 203 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 RTL1A6NKG5 1358 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM37O94972 964 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC125Q86Z20 511 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-211ENST00000588374 EYA1Q99502 592 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms