RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa30.6■■■□□ 2.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GGNBP2Q9H3C7 697 aa30.59■■■□□ 2.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PANK3Q9H999 370 aa30.58■■■□□ 2.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC7Q96M83 1385 aa30.57■■■□□ 2.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa30.55■■■□□ 2.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RGPD5Q99666 1765 aa30.55■■■□□ 2.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa30.53■■■□□ 2.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AXIN2Q9Y2T1 843 aa30.53■■■□□ 2.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CRB1P82279 1406 aa30.53■■■□□ 2.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.52■■■□□ 2.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR17Q8IZU2 1322 aa30.5■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa30.5■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NSD2O96028 1365 aa30.5■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SEPT12Q8IYM1 358 aa30.49■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAP3K19Q56UN5 1328 aa30.48■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RTL1A6NKG5 1358 aa30.47■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BRWD3Q6RI45 1802 aa30.46■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TCP11L2Q8N4U5 519 aa30.46■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A0G2JS52 829 aa30.45■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYT1Q01538 1121 aa30.45■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BARGINQ6ZT62 677 aa30.45■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa30.45■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IP6K1Q92551 441 aa30.45■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 USP35Q9P2H5 1018 aa30.45■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KNSTRNQ9Y448 316 aa30.45■■■□□ 2.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERBB3P21860 1342 aa30.45■■■□□ 2.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa30.44■■■□□ 2.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FBLN1P23142 703 aa30.43■■■□□ 2.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AMPHP49418 695 aa30.43■■■□□ 2.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF24Q5T7B8 1368 aa30.42■■■□□ 2.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HOXC9P31274 260 aa30.4■■■□□ 2.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CARD10Q9BWT7 1032 aa30.4■■■□□ 2.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WNK3Q9BYP7 1800 aa30.4■■■□□ 2.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD24Q8TF21 1146 aa30.39■■■□□ 2.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PEAK1Q9H792 1746 aa30.38■■■□□ 2.45
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FLT4P35916 1363 aa30.37■■■□□ 2.45
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KRT27Q7Z3Y8 459 aa30.36■■■□□ 2.45
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 INSRP06213 1382 aa30.32■■■□□ 2.44
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.32■■■□□ 2.44
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NLRP2Q9NX02 1062 aa30.32■■■□□ 2.44
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa30.32■■■□□ 2.44
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DISP2A7MBM2 1401 aa30.31■■■□□ 2.44
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MORC1Q86VD1 984 aa30.31■■■□□ 2.44
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC37A3O60309 1634 aa30.31■■■□□ 2.44
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa30.29■■■□□ 2.44
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POLKQ9UBT6 870 aa30.28■■■□□ 2.44
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa30.26■■■□□ 2.43
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDE3BQ13370 1112 aa30.25■■■□□ 2.43
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RGPD2P0DJD1 1756 aa30.23■■■□□ 2.43
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDB1Q16531 1140 aa30.22■■■□□ 2.43
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNS2Q63HR2 1409 aa30.21■■■□□ 2.43
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IL2RBP14784 551 aa30.2■■■□□ 2.43
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC125Q86Z20 511 aa30.19■■■□□ 2.42
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM182BQ5T319 152 aa30.17■■■□□ 2.42
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NBPF6Q5VWK0 638 aa30.16■■■□□ 2.42
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM196AQ6ZSG2 479 aa30.16■■■□□ 2.42
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NBPF4Q96M43 638 aa30.16■■■□□ 2.42
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa30.15■■■□□ 2.42
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RGPD1P0DJD0 1748 aa30.14■■■□□ 2.42
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EXOC5O00471 708 aa30.14■■■□□ 2.42
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NCAPD2Q15021 1401 aa30.13■■■□□ 2.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MEGF6O75095 1541 aa30.11■■■□□ 2.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 USHBP1Q8N6Y0 703 aa30.1■■■□□ 2.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EP400Q96L91 3159 aa30.09■■■□□ 2.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCL9O00512 1426 aa30.09■■■□□ 2.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa30.07■■■□□ 2.4
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EYA1Q99502 592 aa30.06■■■□□ 2.4
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MTHFSP49914 203 aa30.05■■■□□ 2.4
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TATP17735 454 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SHANK3Q9BYB0 1731 aa30.03■■■□□ 2.4
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SBF2Q86WG5 1849 aa30.03■■■□□ 2.4
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGSF1Q8N6C5 1336 aa30.02■■■□□ 2.4
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM37O94972 964 aa30.01■■■□□ 2.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.99■■■□□ 2.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BAG6P46379 1132 aa29.99■■■□□ 2.39
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