RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CRB1P82279 1406 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A0G2JS52 829 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 FYB1O15117 783 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 MYT1Q01538 1121 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 NSD2O96028 1365 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 RGPD5Q99666 1765 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 RTL1A6NKG5 1358 aa21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.68■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 BARGINQ6ZT62 677 aa21.68■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.68■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.68■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.68■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.68■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.67■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.67■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 PANK3Q9H999 370 aa21.67■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.67■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.66■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.66■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 AMPHP49418 695 aa21.65■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC7Q96M83 1385 aa21.64■■□□□ 1.06
RABGGTA-205ENST00000558534 IP6K1Q92551 441 aa21.64■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 USP35Q9P2H5 1018 aa21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 WNK3Q9BYP7 1800 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ERBB3P21860 1342 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC125Q86Z20 511 aa21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 FLT4P35916 1363 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.59■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 HOXC9P31274 260 aa21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PDE3BQ13370 1112 aa21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-205ENST00000558534 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-205ENST00000558534 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-205ENST00000558534 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-205ENST00000558534 INSRP06213 1382 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-205ENST00000558534 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-205ENST00000558534 MORC1Q86VD1 984 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-205ENST00000558534 DDB1Q16531 1140 aa21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC37A3O60309 1634 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-205ENST00000558534 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.52■■□□□ 1.03
RABGGTA-205ENST00000558534 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-205ENST00000558534 EP400Q96L91 3159 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-205ENST00000558534 IL2RBP14784 551 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-205ENST00000558534 DISP2A7MBM2 1401 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-205ENST00000558534 EXOC5O00471 708 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-205ENST00000558534 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-205ENST00000558534 PEAK1Q9H792 1746 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-205ENST00000558534 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-205ENST00000558534 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-205ENST00000558534 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-205ENST00000558534 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-205ENST00000558534 TNS2Q63HR2 1409 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-205ENST00000558534 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-205ENST00000558534 FBLN1P23142 703 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-205ENST00000558534 POLKQ9UBT6 870 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-205ENST00000558534 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-205ENST00000558534 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-205ENST00000558534 BCL9O00512 1426 aa21.42■■□□□ 1.02
RABGGTA-205ENST00000558534 BAG6P46379 1132 aa21.42■■□□□ 1.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.42■■□□□ 1.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.41■■□□□ 1.02
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RABGGTA-205ENST00000558534 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-205ENST00000558534 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-205ENST00000558534 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-205ENST00000558534 NBPF4Q96M43 638 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-205ENST00000558534 SBF2Q86WG5 1849 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-205ENST00000558534 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM182BQ5T319 152 aa21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-205ENST00000558534 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-205ENST00000558534 NCAPD2Q15021 1401 aa21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-205ENST00000558534 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-205ENST00000558534 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
RABGGTA-205ENST00000558534 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.33■■□□□ 1.01
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM37O94972 964 aa21.33■■□□□ 1.01
RABGGTA-205ENST00000558534 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.32■■□□□ 1
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.32■■□□□ 1
RABGGTA-205ENST00000558534 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.32■■□□□ 1
RABGGTA-205ENST00000558534 MEGF6O75095 1541 aa21.32■■□□□ 1
RABGGTA-205ENST00000558534 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.32■■□□□ 1
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