RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
TPCN1-222	ENST00000552897	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
TPCN1-222	ENST00000552897	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		33.4	■■■□□ 2.94
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC7	Q96M83	1385 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TPCN1-222	ENST00000552897	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
TPCN1-222	ENST00000552897	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		33.38	■■■□□ 2.93
TPCN1-222	ENST00000552897	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
TPCN1-222	ENST00000552897	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		33.35	■■■□□ 2.93
TPCN1-222	ENST00000552897	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TPCN1-222	ENST00000552897	USP35	Q9P2H5	1018 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TPCN1-222	ENST00000552897	RGPD5	Q99666	1765 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TPCN1-222	ENST00000552897	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.32	■■■□□ 2.93
TPCN1-222	ENST00000552897	LTN1	O94822	1766 aa		33.32	■■■□□ 2.92
TPCN1-222	ENST00000552897	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
TPCN1-222	ENST00000552897	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TPCN1-222	ENST00000552897	ABCC6	O95255	1503 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TPCN1-222	ENST00000552897	IP6K1	Q92551	441 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TPCN1-222	ENST00000552897	CRB1	P82279	1406 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TPCN1-222	ENST00000552897	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		33.26	■■■□□ 2.91
TPCN1-222	ENST00000552897	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		33.26	■■■□□ 2.91
TPCN1-222	ENST00000552897	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
TPCN1-222	ENST00000552897	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TPCN1-222	ENST00000552897	HOXC9	P31274	260 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TPCN1-222	ENST00000552897	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TPCN1-222	ENST00000552897	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TPCN1-222	ENST00000552897		A0A0G2JS52	829 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TPCN1-222	ENST00000552897	MYT1	Q01538	1121 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TPCN1-222	ENST00000552897	ERBB3	P21860	1342 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TPCN1-222	ENST00000552897	AMPH	P49418	695 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TPCN1-222	ENST00000552897	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TPCN1-222	ENST00000552897	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TPCN1-222	ENST00000552897	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TPCN1-222	ENST00000552897	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
TPCN1-222	ENST00000552897	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
TPCN1-222	ENST00000552897	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	33.19	■■■□□ 2.9
TPCN1-222	ENST00000552897	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
TPCN1-222	ENST00000552897	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		33.19	■■■□□ 2.9
TPCN1-222	ENST00000552897	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
TPCN1-222	ENST00000552897	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		33.19	■■■□□ 2.9
TPCN1-222	ENST00000552897	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
TPCN1-222	ENST00000552897	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
TPCN1-222	ENST00000552897	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TPCN1-222	ENST00000552897	PEAK1	Q9H792	1746 aa		33.16	■■■□□ 2.9
TPCN1-222	ENST00000552897	RTL1	A6NKG5	1358 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TPCN1-222	ENST00000552897	NSD2	O96028	1365 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TPCN1-222	ENST00000552897	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TPCN1-222	ENST00000552897	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TPCN1-222	ENST00000552897	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		33.14	■■■□□ 2.9
TPCN1-222	ENST00000552897	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.13	■■■□□ 2.89
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM182B	Q5T319	152 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TPCN1-222	ENST00000552897	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.11	■■■□□ 2.89
TPCN1-222	ENST00000552897	FLT4	P35916	1363 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TPCN1-222	ENST00000552897	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
TPCN1-222	ENST00000552897	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TPCN1-222	ENST00000552897	DISP2	A7MBM2	1401 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TPCN1-222	ENST00000552897	INSR	P06213	1382 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TPCN1-222	ENST00000552897	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.89
TPCN1-222	ENST00000552897	EP400	Q96L91	3159 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TPCN1-222	ENST00000552897	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
TPCN1-222	ENST00000552897	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TPCN1-222	ENST00000552897	NBPF4	Q96M43	638 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TPCN1-222	ENST00000552897	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
TPCN1-222	ENST00000552897	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TPCN1-222	ENST00000552897	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		33.01	■■■□□ 2.88
TPCN1-222	ENST00000552897	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.01	■■■□□ 2.87
TPCN1-222	ENST00000552897	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
TPCN1-222	ENST00000552897	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
TPCN1-222	ENST00000552897	DDB1	Q16531	1140 aa		33	■■■□□ 2.87
TPCN1-222	ENST00000552897	LRRC37A3	O60309	1634 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TPCN1-222	ENST00000552897	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TPCN1-222	ENST00000552897	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
TPCN1-222	ENST00000552897	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
TPCN1-222	ENST00000552897	IL2RB	P14784	551 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TPCN1-222	ENST00000552897	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
TPCN1-222	ENST00000552897	EXOC5	O00471	708 aa		32.93	■■■□□ 2.86
TPCN1-222	ENST00000552897	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		32.91	■■■□□ 2.86
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC125	Q86Z20	511 aa		32.89	■■■□□ 2.86
TPCN1-222	ENST00000552897	EYA1	Q99502	592 aa		32.89	■■■□□ 2.86
TPCN1-222	ENST00000552897	MEGF6	O75095	1541 aa		32.88	■■■□□ 2.85
TPCN1-222	ENST00000552897	TNS2	Q63HR2	1409 aa		32.88	■■■□□ 2.85
TPCN1-222	ENST00000552897	MTHFS	P49914	203 aa		32.88	■■■□□ 2.85
TPCN1-222	ENST00000552897	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
TPCN1-222	ENST00000552897	TRIM37	O94972	964 aa		32.85	■■■□□ 2.85
TPCN1-222	ENST00000552897	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.85	■■■□□ 2.85
TPCN1-222	ENST00000552897	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TPCN1-222	ENST00000552897	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TPCN1-222	ENST00000552897	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		32.8	■■■□□ 2.84
TPCN1-222	ENST00000552897	IL13	P35225	146 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TPCN1-222	ENST00000552897	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TPCN1-222	ENST00000552897	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
TPCN1-222	ENST00000552897	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
TPCN1-222	ENST00000552897	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TPCN1-222	ENST00000552897	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
TPCN1-222	ENST00000552897	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
TPCN1-222	ENST00000552897	BCL9	O00512	1426 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TPCN1-222	ENST00000552897	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
TPCN1-222	ENST00000552897	PPP2R1A	P30153	589 aa		32.74	■■■□□ 2.83

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