RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525194.5

ACER3-202, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-202ENST00000525194 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.39■■■□□ 2.3
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ACER3-202ENST00000525194 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.38■■■□□ 2.29
ACER3-202ENST00000525194 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
ACER3-202ENST00000525194 ABCC6O95255 1503 aa29.37■■■□□ 2.29
ACER3-202ENST00000525194 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.37■■■□□ 2.29
ACER3-202ENST00000525194 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
ACER3-202ENST00000525194 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
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ACER3-202ENST00000525194 ABCA3Q99758 1704 aa29.36■■■□□ 2.29
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ACER3-202ENST00000525194 RUNDC1Q96C34 613 aa29.29■■■□□ 2.28
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ACER3-202ENST00000525194 NEFMP07197 916 aa29.27■■■□□ 2.28
ACER3-202ENST00000525194 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.25■■■□□ 2.27
ACER3-202ENST00000525194 NGEFQ8N5V2 710 aa29.25■■■□□ 2.27
ACER3-202ENST00000525194 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
ACER3-202ENST00000525194 COL18A1P39060 1754 aa29.25■■■□□ 2.27
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ACER3-202ENST00000525194 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.23■■■□□ 2.27
ACER3-202ENST00000525194 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.22■■■□□ 2.27
ACER3-202ENST00000525194 CHRNA2Q15822 529 aa29.22■■■□□ 2.27
ACER3-202ENST00000525194 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.22■■■□□ 2.27
ACER3-202ENST00000525194 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.22■■■□□ 2.27
ACER3-202ENST00000525194 EYA1Q99502 592 aa29.21■■■□□ 2.27
ACER3-202ENST00000525194 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.2■■■□□ 2.27
ACER3-202ENST00000525194 HMOX1P09601 288 aa29.2■■■□□ 2.26
ACER3-202ENST00000525194 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.2■■■□□ 2.26
ACER3-202ENST00000525194 ERBB3P21860 1342 aa29.2■■■□□ 2.26
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ACER3-202ENST00000525194 PRKAR2BP31323 418 aa29.18■■■□□ 2.26
ACER3-202ENST00000525194 HSPA1LP34931 641 aa29.18■■■□□ 2.26
ACER3-202ENST00000525194 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
ACER3-202ENST00000525194 RGPD5Q99666 1765 aa29.18■■■□□ 2.26
ACER3-202ENST00000525194 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.18■■■□□ 2.26
ACER3-202ENST00000525194 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
ACER3-202ENST00000525194 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.18■■■□□ 2.26
ACER3-202ENST00000525194 KDRP35968 1356 aa29.17■■■□□ 2.26
ACER3-202ENST00000525194 APAF1O14727 1248 aa29.17■■■□□ 2.26
ACER3-202ENST00000525194 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
ACER3-202ENST00000525194 FAM83GA6ND36 823 aa29.16■■■□□ 2.26
ACER3-202ENST00000525194 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
ACER3-202ENST00000525194 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.15■■■□□ 2.26
ACER3-202ENST00000525194 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.15■■■□□ 2.26
ACER3-202ENST00000525194 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.13■■■□□ 2.25
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ACER3-202ENST00000525194 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
ACER3-202ENST00000525194 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.13■■■□□ 2.25
ACER3-202ENST00000525194 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
ACER3-202ENST00000525194 NBPF4Q96M43 638 aa29.13■■■□□ 2.25
ACER3-202ENST00000525194 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.12■■■□□ 2.25
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ACER3-202ENST00000525194 NCAPD2Q15021 1401 aa29.11■■■□□ 2.25
ACER3-202ENST00000525194 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
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ACER3-202ENST00000525194 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.1■■■□□ 2.25
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ACER3-202ENST00000525194 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
ACER3-202ENST00000525194 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.06■■■□□ 2.24
ACER3-202ENST00000525194 NFE2L2Q16236 605 aa29.06■■■□□ 2.24
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ACER3-202ENST00000525194 PDE3BQ13370 1112 aa29.05■■■□□ 2.24
ACER3-202ENST00000525194 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.05■■■□□ 2.24
ACER3-202ENST00000525194 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.05■■■□□ 2.24
ACER3-202ENST00000525194 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.05■■■□□ 2.24
ACER3-202ENST00000525194 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa29.03■■■□□ 2.24
ACER3-202ENST00000525194 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.03■■■□□ 2.24
ACER3-202ENST00000525194 NEUROD2Q15784 382 aa29.03■■■□□ 2.24
ACER3-202ENST00000525194 STRN4Q9NRL3 753 aa29.03■■■□□ 2.24
ACER3-202ENST00000525194 RIPK4P57078 832 aa29.02■■■□□ 2.24
ACER3-202ENST00000525194 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.02■■■□□ 2.24
ACER3-202ENST00000525194 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.02■■■□□ 2.24
ACER3-202ENST00000525194 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.02■■■□□ 2.24
ACER3-202ENST00000525194 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
ACER3-202ENST00000525194 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.02■■■□□ 2.24
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ACER3-202ENST00000525194 NWD2Q9ULI1 1742 aa29■■■□□ 2.23
ACER3-202ENST00000525194 CRB1P82279 1406 aa29■■■□□ 2.23
ACER3-202ENST00000525194 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.99■■■□□ 2.23
ACER3-202ENST00000525194 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
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ACER3-202ENST00000525194 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
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ACER3-202ENST00000525194 WWC1Q8IX03 1113 aa28.98■■■□□ 2.23
ACER3-202ENST00000525194 FBXO41Q8TF61 875 aa28.98■■■□□ 2.23
ACER3-202ENST00000525194 ZNF521Q96K83 1311 aa28.97■■■□□ 2.23
ACER3-202ENST00000525194 NGLY1Q96IV0 654 aa28.97■■■□□ 2.23
ACER3-202ENST00000525194 SLIT2O94813 1529 aa28.97■■■□□ 2.23
ACER3-202ENST00000525194 WDR63Q8IWG1 891 aa28.96■■■□□ 2.23
ACER3-202ENST00000525194 GOLGA2Q08379 1002 aa28.95■■■□□ 2.22
ACER3-202ENST00000525194 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
ACER3-202ENST00000525194 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
ACER3-202ENST00000525194 LRP6O75581 1613 aa28.94■■■□□ 2.22
ACER3-202ENST00000525194 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
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