RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514485.5

PACRGL-231, Transcript of parkin coregulated like, human

TSL 3

Gene PACRGL, Length 860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PACRGL-231	ENST00000514485	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	PEAK1	Q9H792	1746 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	RREB1	Q92766	1687 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	TRIM37	O94972	964 aa		29.81	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	LRP5	O75197	1615 aa		29.81	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	PDE3B	Q13370	1112 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	SOX12	O15370	315 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	SLC24A1	O60721	1099 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	TMF1	P82094	1093 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
PACRGL-231	ENST00000514485	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.35
PACRGL-231	ENST00000514485	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PACRGL-231	ENST00000514485	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PACRGL-231	ENST00000514485	ABCC6	O95255	1503 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PACRGL-231	ENST00000514485	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PACRGL-231	ENST00000514485	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	29.73	■■■□□ 2.35
PACRGL-231	ENST00000514485	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PACRGL-231	ENST00000514485	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	29.71	■■■□□ 2.35
PACRGL-231	ENST00000514485	USP31	Q70CQ4	1352 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PACRGL-231	ENST00000514485		A0A1W2PP64	1363 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PACRGL-231	ENST00000514485	APBA3	O96018	575 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PACRGL-231	ENST00000514485	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	29.69	■■■□□ 2.34
PACRGL-231	ENST00000514485	NME9	Q86XW9	330 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PACRGL-231	ENST00000514485	MYOM1	P52179	1685 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PACRGL-231	ENST00000514485	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PACRGL-231	ENST00000514485	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
PACRGL-231	ENST00000514485	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PACRGL-231	ENST00000514485	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PACRGL-231	ENST00000514485	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PACRGL-231	ENST00000514485	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PACRGL-231	ENST00000514485	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
PACRGL-231	ENST00000514485	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	29.67	■■■□□ 2.34
PACRGL-231	ENST00000514485	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PACRGL-231	ENST00000514485	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PACRGL-231	ENST00000514485	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	29.65	■■■□□ 2.34
PACRGL-231	ENST00000514485	DDB1	Q16531	1140 aa		29.64	■■■□□ 2.34
PACRGL-231	ENST00000514485	CDCA8	Q53HL2	280 aa		29.64	■■■□□ 2.34
PACRGL-231	ENST00000514485	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		29.62	■■■□□ 2.33
PACRGL-231	ENST00000514485	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		29.62	■■■□□ 2.33
PACRGL-231	ENST00000514485	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		29.6	■■■□□ 2.33
PACRGL-231	ENST00000514485	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		29.58	■■■□□ 2.33
PACRGL-231	ENST00000514485	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	29.57	■■■□□ 2.32
PACRGL-231	ENST00000514485	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	29.57	■■■□□ 2.32
PACRGL-231	ENST00000514485	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	29.57	■■■□□ 2.32
PACRGL-231	ENST00000514485	CCDC7	Q96M83	1385 aa		29.56	■■■□□ 2.32
PACRGL-231	ENST00000514485	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		29.55	■■■□□ 2.32
PACRGL-231	ENST00000514485	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	29.54	■■■□□ 2.32
PACRGL-231	ENST00000514485	ERBB3	P21860	1342 aa		29.54	■■■□□ 2.32
PACRGL-231	ENST00000514485	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		29.54	■■■□□ 2.32
PACRGL-231	ENST00000514485	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		29.54	■■■□□ 2.32
PACRGL-231	ENST00000514485	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		29.54	■■■□□ 2.32
PACRGL-231	ENST00000514485	TNS2	Q63HR2	1409 aa		29.54	■■■□□ 2.32
PACRGL-231	ENST00000514485	BCL9	O00512	1426 aa		29.52	■■■□□ 2.32
PACRGL-231	ENST00000514485	NHS	Q6T4R5	1651 aa		29.5	■■■□□ 2.31
PACRGL-231	ENST00000514485	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		29.48	■■■□□ 2.31
PACRGL-231	ENST00000514485	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	29.48	■■■□□ 2.31
PACRGL-231	ENST00000514485	EXOC5	O00471	708 aa		29.47	■■■□□ 2.31
PACRGL-231	ENST00000514485	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		29.47	■■■□□ 2.31
PACRGL-231	ENST00000514485	PLSCR1	O15162	318 aa		29.45	■■■□□ 2.31
PACRGL-231	ENST00000514485	BTAF1	O14981	1849 aa		29.44	■■■□□ 2.3
PACRGL-231	ENST00000514485	NBPF14	Q5TI25	921 aa		29.44	■■■□□ 2.3
PACRGL-231	ENST00000514485	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		29.43	■■■□□ 2.3
PACRGL-231	ENST00000514485	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		29.43	■■■□□ 2.3
PACRGL-231	ENST00000514485	CASZ1	Q86V15	1759 aa		29.42	■■■□□ 2.3
PACRGL-231	ENST00000514485	COG3	Q96JB2	828 aa		29.42	■■■□□ 2.3
PACRGL-231	ENST00000514485	FBLN1	P23142	703 aa		29.41	■■■□□ 2.3
PACRGL-231	ENST00000514485	IP6K1	Q92551	441 aa		29.41	■■■□□ 2.3
PACRGL-231	ENST00000514485	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		29.4	■■■□□ 2.3
PACRGL-231	ENST00000514485	IL2RB	P14784	551 aa		29.4	■■■□□ 2.3
PACRGL-231	ENST00000514485	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		29.4	■■■□□ 2.3
PACRGL-231	ENST00000514485	FYB1	O15117	783 aa		29.39	■■■□□ 2.3
PACRGL-231	ENST00000514485	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		29.39	■■■□□ 2.3
PACRGL-231	ENST00000514485	PROM2	Q8N271	834 aa		29.38	■■■□□ 2.29
PACRGL-231	ENST00000514485	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	29.38	■■■□□ 2.29
PACRGL-231	ENST00000514485	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	29.37	■■■□□ 2.29
PACRGL-231	ENST00000514485	KCNQ2	O43526	872 aa		29.36	■■■□□ 2.29
PACRGL-231	ENST00000514485	HOXC9	P31274	260 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PACRGL-231	ENST00000514485	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PACRGL-231	ENST00000514485	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PACRGL-231	ENST00000514485	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PACRGL-231	ENST00000514485	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PACRGL-231	ENST00000514485	PANK3	Q9H999	370 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PACRGL-231	ENST00000514485	AMPH	P49418	695 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PACRGL-231	ENST00000514485	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	29.3	■■■□□ 2.28
PACRGL-231	ENST00000514485	TXNRD1	Q16881	649 aa		29.3	■■■□□ 2.28
PACRGL-231	ENST00000514485	RTL1	A6NKG5	1358 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PACRGL-231	ENST00000514485	PAPPA	Q13219	1627 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PACRGL-231	ENST00000514485	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	29.29	■■■□□ 2.28
PACRGL-231	ENST00000514485	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PACRGL-231	ENST00000514485	MEGF6	O75095	1541 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PACRGL-231	ENST00000514485	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	29.26	■■■□□ 2.27
PACRGL-231	ENST00000514485	SPON1	Q9HCB6	807 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PACRGL-231	ENST00000514485	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27

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