RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-220ENST00000511663 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-220ENST00000511663 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-220ENST00000511663 LRP5O75197 1615 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-220ENST00000511663 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-220ENST00000511663 AKAP12Q02952 1782 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-220ENST00000511663 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-220ENST00000511663 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-220ENST00000511663 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-220ENST00000511663 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-220ENST00000511663 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-220ENST00000511663 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-220ENST00000511663 EXOC5O00471 708 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC24A1O60721 1099 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-220ENST00000511663 COL18A1P39060 1754 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-220ENST00000511663 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
SH3BP2-220ENST00000511663 PLSCR1O15162 318 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP2-220ENST00000511663 NME9Q86XW9 330 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP2-220ENST00000511663 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
SH3BP2-220ENST00000511663 USP31Q70CQ4 1352 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC7Q96M83 1385 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BP2-220ENST00000511663 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
SH3BP2-220ENST00000511663 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.13■■□□□ 1.93
SH3BP2-220ENST00000511663 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.13■■□□□ 1.93
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC37A3O60309 1634 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP2-220ENST00000511663 RGPD5Q99666 1765 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP2-220ENST00000511663 NFAT5O94916 1531 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-220ENST00000511663 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-220ENST00000511663 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-220ENST00000511663 RREB1Q92766 1687 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-220ENST00000511663 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCC6O95255 1503 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-220ENST00000511663 PEAK1Q9H792 1746 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-220ENST00000511663 SPON1Q9HCB6 807 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-220ENST00000511663 ERBB3P21860 1342 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1W2PP64 1363 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-220ENST00000511663 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-220ENST00000511663 BCL9O00512 1426 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-220ENST00000511663 IL2RBP14784 551 aa27.06■■□□□ 1.92
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
SH3BP2-220ENST00000511663 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.06■■□□□ 1.92
SH3BP2-220ENST00000511663 PTF1AQ7RTS3 328 aa27.05■■□□□ 1.92
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNQ2O43526 872 aa27.04■■□□□ 1.92
SH3BP2-220ENST00000511663 COG3Q96JB2 828 aa27.04■■□□□ 1.92
SH3BP2-220ENST00000511663 TESK2Q96S53 571 aa27.04■■□□□ 1.92
SH3BP2-220ENST00000511663 SBF2Q86WG5 1849 aa27.04■■□□□ 1.92
SH3BP2-220ENST00000511663 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.04■■□□□ 1.92
SH3BP2-220ENST00000511663 IP6K1Q92551 441 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP2-220ENST00000511663 TMF1P82094 1093 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP2-220ENST00000511663 TNS2Q63HR2 1409 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP2-220ENST00000511663 USP54Q70EL1 1684 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP2-220ENST00000511663 TXNRD1Q16881 649 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP2-220ENST00000511663 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
SH3BP2-220ENST00000511663 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP2-220ENST00000511663 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP2-220ENST00000511663 PROM2Q8N271 834 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP2-220ENST00000511663 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SH3BP2-220ENST00000511663 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP2-220ENST00000511663 STK32BQ9NY57 414 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP2-220ENST00000511663 LTN1O94822 1766 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP2-220ENST00000511663 AMPHP49418 695 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BP2-220ENST00000511663 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SH3BP2-220ENST00000511663 CDCA8Q53HL2 280 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC15A2Q16348 729 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-220ENST00000511663 USP47Q96K76 1375 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-220ENST00000511663 HOXC9P31274 260 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB7AO95365 584 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-220ENST00000511663 FBLN1P23142 703 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-220ENST00000511663 FYB1O15117 783 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-220ENST00000511663 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-220ENST00000511663 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SH3BP2-220ENST00000511663 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP2-220ENST00000511663 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SH3BP2-220ENST00000511663 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP2-220ENST00000511663 NHSQ6T4R5 1651 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP2-220ENST00000511663 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SH3BP2-220ENST00000511663 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SH3BP2-220ENST00000511663 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SH3BP2-220ENST00000511663 MTFR1LQ9H019 292 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP2-220ENST00000511663 RTL1A6NKG5 1358 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BP2-220ENST00000511663 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-220ENST00000511663 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-220ENST00000511663 CASZ1Q86V15 1759 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-220ENST00000511663 YY1P25490 414 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-220ENST00000511663 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-220ENST00000511663 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-220ENST00000511663 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-220ENST00000511663 PTGER2P43116 358 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-220ENST00000511663 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-220ENST00000511663 NBPF4Q96M43 638 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-220ENST00000511663 BTAF1O14981 1849 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-220ENST00000511663 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms