RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.23■■□□□ 1.79
PITX1-204ENST00000504936 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.22■■□□□ 1.79
PITX1-204ENST00000504936 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.22■■□□□ 1.79
PITX1-204ENST00000504936 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.22■■□□□ 1.79
PITX1-204ENST00000504936 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.21■■□□□ 1.79
PITX1-204ENST00000504936 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.21■■□□□ 1.79
PITX1-204ENST00000504936 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.21■■□□□ 1.79
PITX1-204ENST00000504936 ABCC6O95255 1503 aa26.2■■□□□ 1.79
PITX1-204ENST00000504936 FYB1O15117 783 aa26.2■■□□□ 1.78
PITX1-204ENST00000504936 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
PITX1-204ENST00000504936 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.19■■□□□ 1.78
PITX1-204ENST00000504936 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.19■■□□□ 1.78
PITX1-204ENST00000504936 PANK3Q9H999 370 aa26.19■■□□□ 1.78
PITX1-204ENST00000504936 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.18■■□□□ 1.78
PITX1-204ENST00000504936 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.17■■□□□ 1.78
PITX1-204ENST00000504936 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.17■■□□□ 1.78
PITX1-204ENST00000504936 CRB1P82279 1406 aa26.16■■□□□ 1.78
PITX1-204ENST00000504936 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.16■■□□□ 1.78
PITX1-204ENST00000504936 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PITX1-204ENST00000504936 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.15■■□□□ 1.78
PITX1-204ENST00000504936 AMPHP49418 695 aa26.14■■□□□ 1.78
PITX1-204ENST00000504936 CCDC7Q96M83 1385 aa26.13■■□□□ 1.77
PITX1-204ENST00000504936 FBLN1P23142 703 aa26.13■■□□□ 1.77
PITX1-204ENST00000504936 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.13■■□□□ 1.77
PITX1-204ENST00000504936 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.12■■□□□ 1.77
PITX1-204ENST00000504936 EP400Q96L91 3159 aa26.12■■□□□ 1.77
PITX1-204ENST00000504936 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PITX1-204ENST00000504936 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.12■■□□□ 1.77
PITX1-204ENST00000504936 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PITX1-204ENST00000504936 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PITX1-204ENST00000504936 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.1■■□□□ 1.77
PITX1-204ENST00000504936 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.1■■□□□ 1.77
PITX1-204ENST00000504936 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PITX1-204ENST00000504936 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.09■■□□□ 1.77
PITX1-204ENST00000504936 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PITX1-204ENST00000504936 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.08■■□□□ 1.77
PITX1-204ENST00000504936 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.08■■□□□ 1.77
PITX1-204ENST00000504936 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 IP6K1Q92551 441 aa26.07■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.07■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 ERBB3P21860 1342 aa26.07■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 RTL1A6NKG5 1358 aa26.06■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 PEAK1Q9H792 1746 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 HOXC9P31274 260 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 BARGINQ6ZT62 677 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 NSD2O96028 1365 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 LRRC37A3O60309 1634 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.03■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PITX1-204ENST00000504936 FLT4P35916 1363 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-204ENST00000504936 PDE3BQ13370 1112 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-204ENST00000504936 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26■■□□□ 1.75
PITX1-204ENST00000504936 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PITX1-204ENST00000504936 MORC1Q86VD1 984 aa26■■□□□ 1.75
PITX1-204ENST00000504936 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26■■□□□ 1.75
PITX1-204ENST00000504936 FAM182BQ5T319 152 aa25.99■■□□□ 1.75
PITX1-204ENST00000504936 DDB1Q16531 1140 aa25.96■■□□□ 1.75
PITX1-204ENST00000504936 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.96■■□□□ 1.75
PITX1-204ENST00000504936 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PITX1-204ENST00000504936 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.95■■□□□ 1.74
PITX1-204ENST00000504936 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PITX1-204ENST00000504936 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.94■■□□□ 1.74
PITX1-204ENST00000504936 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PITX1-204ENST00000504936 INSRP06213 1382 aa25.94■■□□□ 1.74
PITX1-204ENST00000504936 DISP2A7MBM2 1401 aa25.91■■□□□ 1.74
PITX1-204ENST00000504936 IL2RBP14784 551 aa25.91■■□□□ 1.74
PITX1-204ENST00000504936 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PITX1-204ENST00000504936 POLKQ9UBT6 870 aa25.9■■□□□ 1.74
PITX1-204ENST00000504936 TNS2Q63HR2 1409 aa25.89■■□□□ 1.74
PITX1-204ENST00000504936 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.89■■□□□ 1.74
PITX1-204ENST00000504936 SBF2Q86WG5 1849 aa25.88■■□□□ 1.73
PITX1-204ENST00000504936 EXOC5O00471 708 aa25.88■■□□□ 1.73
PITX1-204ENST00000504936 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.88■■□□□ 1.73
PITX1-204ENST00000504936 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PITX1-204ENST00000504936 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.88■■□□□ 1.73
PITX1-204ENST00000504936 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PITX1-204ENST00000504936 CCDC125Q86Z20 511 aa25.86■■□□□ 1.73
PITX1-204ENST00000504936 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.84■■□□□ 1.73
PITX1-204ENST00000504936 NBPF4Q96M43 638 aa25.84■■□□□ 1.73
PITX1-204ENST00000504936 TRIM37O94972 964 aa25.83■■□□□ 1.73
PITX1-204ENST00000504936 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.82■■□□□ 1.72
PITX1-204ENST00000504936 MEGF6O75095 1541 aa25.81■■□□□ 1.72
PITX1-204ENST00000504936 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.8■■□□□ 1.72
PITX1-204ENST00000504936 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.8■■□□□ 1.72
PITX1-204ENST00000504936 BAG6P46379 1132 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX1-204ENST00000504936 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PITX1-204ENST00000504936 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PITX1-204ENST00000504936 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PITX1-204ENST00000504936 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-204ENST00000504936 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PITX1-204ENST00000504936 EYA1Q99502 592 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-204ENST00000504936 MTHFSP49914 203 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-204ENST00000504936 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-204ENST00000504936 APBA3O96018 575 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX1-204ENST00000504936 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms