RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF697Q5TEC3 545 aa6.37□□□□□ -1.39
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RABGGTB-211ENST00000489450 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
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RABGGTB-211ENST00000489450 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-211ENST00000489450 CDK15Q96Q40 435 aa6.32□□□□□ -1.4
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RABGGTB-211ENST00000489450 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.31□□□□□ -1.4
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RABGGTB-211ENST00000489450 ADH1CP00326 375 aa6.3□□□□□ -1.4
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RABGGTB-211ENST00000489450 USP17L4A6NCW7 530 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-211ENST00000489450 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-211ENST00000489450 CDCA8Q53HL2 280 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-211ENST00000489450 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGGTB-211ENST00000489450 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-211ENST00000489450 AVPP01185 164 aa6.25□□□□□ -1.41
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RABGGTB-211ENST00000489450 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-211ENST00000489450 TREML4Q6UXN2 200 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-211ENST00000489450 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-211ENST00000489450 CYLDQ9NQC7 956 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-211ENST00000489450 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC125Q86Z20 511 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-211ENST00000489450 NOD1Q9Y239 953 aa6.23□□□□□ -1.41
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