RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		40.82	■■■■■ 4.12
FBXO18-208	ENST00000470089	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		40.81	■■■■■ 4.12
FBXO18-208	ENST00000470089	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		40.8	■■■■■ 4.12
FBXO18-208	ENST00000470089	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		40.8	■■■■■ 4.12
FBXO18-208	ENST00000470089	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		40.79	■■■■■ 4.12
FBXO18-208	ENST00000470089	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		40.78	■■■■■ 4.12
FBXO18-208	ENST00000470089	LTN1	O94822	1766 aa		40.77	■■■■■ 4.12
FBXO18-208	ENST00000470089	CRB1	P82279	1406 aa		40.73	■■■■■ 4.11
FBXO18-208	ENST00000470089	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		40.72	■■■■■ 4.11
FBXO18-208	ENST00000470089	COG3	Q96JB2	828 aa		40.71	■■■■■ 4.11
FBXO18-208	ENST00000470089	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		40.69	■■■■■ 4.1
FBXO18-208	ENST00000470089	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		40.68	■■■■■ 4.1
FBXO18-208	ENST00000470089	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		40.67	■■■■■ 4.1
FBXO18-208	ENST00000470089	ABCC6	O95255	1503 aa		40.67	■■■■■ 4.1
FBXO18-208	ENST00000470089	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		40.67	■■■■■ 4.1
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM182B	Q5T319	152 aa		40.66	■■■■■ 4.1
FBXO18-208	ENST00000470089	FYB1	O15117	783 aa		40.65	■■■■■ 4.1
FBXO18-208	ENST00000470089	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		40.65	■■■■■ 4.1
FBXO18-208	ENST00000470089	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		40.65	■■■■■ 4.1
FBXO18-208	ENST00000470089	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		40.65	■■■■■ 4.1
FBXO18-208	ENST00000470089	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	40.64	■■■■■ 4.1
FBXO18-208	ENST00000470089	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		40.63	■■■■■ 4.09
FBXO18-208	ENST00000470089	FBLN1	P23142	703 aa		40.61	■■■■■ 4.09
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC125	Q86Z20	511 aa		40.59	■■■■■ 4.09
FBXO18-208	ENST00000470089	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	40.58	■■■■■ 4.09
FBXO18-208	ENST00000470089	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	40.57	■■■■■ 4.09
FBXO18-208	ENST00000470089	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.09
FBXO18-208	ENST00000470089	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		40.57	■■■■■ 4.09
FBXO18-208	ENST00000470089	ERBB3	P21860	1342 aa		40.53	■■■■■ 4.08
FBXO18-208	ENST00000470089	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		40.53	■■■■■ 4.08
FBXO18-208	ENST00000470089	PDE3B	Q13370	1112 aa		40.53	■■■■■ 4.08
FBXO18-208	ENST00000470089	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		40.53	■■■■■ 4.08
FBXO18-208	ENST00000470089	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		40.51	■■■■■ 4.08
FBXO18-208	ENST00000470089	IP6K1	Q92551	441 aa		40.51	■■■■■ 4.08
FBXO18-208	ENST00000470089	LRRC37A3	O60309	1634 aa		40.49	■■■■■ 4.07
FBXO18-208	ENST00000470089	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	40.49	■■■■■ 4.07
FBXO18-208	ENST00000470089	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	40.48	■■■■■ 4.07
FBXO18-208	ENST00000470089	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		40.48	■■■■■ 4.07
FBXO18-208	ENST00000470089	AMPH	P49418	695 aa		40.47	■■■■■ 4.07
FBXO18-208	ENST00000470089	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
FBXO18-208	ENST00000470089	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		40.45	■■■■■ 4.07
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC7	Q96M83	1385 aa		40.45	■■■■■ 4.07
FBXO18-208	ENST00000470089	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		40.45	■■■■■ 4.07
FBXO18-208	ENST00000470089	HOXC9	P31274	260 aa		40.44	■■■■■ 4.06
FBXO18-208	ENST00000470089	PANK3	Q9H999	370 aa		40.44	■■■■■ 4.06
FBXO18-208	ENST00000470089	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		40.43	■■■■■ 4.06
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		40.43	■■■■■ 4.06
FBXO18-208	ENST00000470089	DDB1	Q16531	1140 aa		40.42	■■■■■ 4.06
FBXO18-208	ENST00000470089	DISP2	A7MBM2	1401 aa		40.42	■■■■■ 4.06
FBXO18-208	ENST00000470089	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	40.4	■■■■■ 4.06
FBXO18-208	ENST00000470089	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		40.39	■■■■■ 4.06
FBXO18-208	ENST00000470089	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	40.38	■■■■■ 4.05
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	40.37	■■■■■ 4.05
FBXO18-208	ENST00000470089	RTL1	A6NKG5	1358 aa		40.37	■■■■■ 4.05
FBXO18-208	ENST00000470089	TRIM37	O94972	964 aa		40.37	■■■■■ 4.05
FBXO18-208	ENST00000470089	PEAK1	Q9H792	1746 aa		40.36	■■■■■ 4.05
FBXO18-208	ENST00000470089	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		40.36	■■■■■ 4.05
FBXO18-208	ENST00000470089	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		40.35	■■■■■ 4.05
FBXO18-208	ENST00000470089	BAG6	P46379	1132 aa		40.32	■■■■■ 4.05
FBXO18-208	ENST00000470089	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		40.31	■■■■■ 4.04
FBXO18-208	ENST00000470089	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		40.3	■■■■■ 4.04
FBXO18-208	ENST00000470089	EXOC5	O00471	708 aa		40.29	■■■■■ 4.04
FBXO18-208	ENST00000470089	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	40.29	■■■■■ 4.04
FBXO18-208	ENST00000470089	IL2RB	P14784	551 aa		40.28	■■■■■ 4.04
FBXO18-208	ENST00000470089	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	40.28	■■■■■ 4.04
FBXO18-208	ENST00000470089	FLT4	P35916	1363 aa		40.27	■■■■■ 4.04
FBXO18-208	ENST00000470089	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		40.27	■■■■■ 4.04
FBXO18-208	ENST00000470089	TNS2	Q63HR2	1409 aa		40.26	■■■■■ 4.04
FBXO18-208	ENST00000470089	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.04
FBXO18-208	ENST00000470089	SBF2	Q86WG5	1849 aa		40.26	■■■■■ 4.03
FBXO18-208	ENST00000470089	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	40.24	■■■■■ 4.03
FBXO18-208	ENST00000470089	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	40.24	■■■■■ 4.03
FBXO18-208	ENST00000470089	INSR	P06213	1382 aa		40.23	■■■■■ 4.03
FBXO18-208	ENST00000470089	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		40.23	■■■■■ 4.03
FBXO18-208	ENST00000470089	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	40.22	■■■■■ 4.03
FBXO18-208	ENST00000470089	APBA3	O96018	575 aa		40.21	■■■■■ 4.03
FBXO18-208	ENST00000470089	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		40.2	■■■■■ 4.03
FBXO18-208	ENST00000470089	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		40.19	■■■■■ 4.02
FBXO18-208	ENST00000470089	NBPF4	Q96M43	638 aa		40.19	■■■■■ 4.02
FBXO18-208	ENST00000470089	NSD2	O96028	1365 aa		40.18	■■■■■ 4.02
FBXO18-208	ENST00000470089	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		40.17	■■■■■ 4.02
FBXO18-208	ENST00000470089	POLK	Q9UBT6	870 aa		40.16	■■■■■ 4.02
FBXO18-208	ENST00000470089	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		40.16	■■■■■ 4.02
FBXO18-208	ENST00000470089	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	40.15	■■■■■ 4.02
FBXO18-208	ENST00000470089	BCL9	O00512	1426 aa		40.11	■■■■■ 4.01
FBXO18-208	ENST00000470089	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		40.11	■■■■■ 4.01
FBXO18-208	ENST00000470089	MORC1	Q86VD1	984 aa		40.11	■■■■■ 4.01
FBXO18-208	ENST00000470089	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		40.11	■■■■■ 4.01
FBXO18-208	ENST00000470089	MEGF6	O75095	1541 aa		40.11	■■■■■ 4.01
FBXO18-208	ENST00000470089	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	40.07	■■■■■ 4.01
FBXO18-208	ENST00000470089	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	40.06	■■■■■ 4
FBXO18-208	ENST00000470089	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	40.05	■■■■■ 4
FBXO18-208	ENST00000470089	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		40.05	■■■■■ 4
FBXO18-208	ENST00000470089	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		40.04	■■■■■ 4
FBXO18-208	ENST00000470089	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		40.03	■■■■■ 4
FBXO18-208	ENST00000470089	RREB1	Q92766	1687 aa		40.02	■■■■■ 4
FBXO18-208	ENST00000470089	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	40.02	■■■■■ 4
FBXO18-208	ENST00000470089	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		40.02	■■■■■ 4
FBXO18-208	ENST00000470089	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		40.01	■■■■■ 4
FBXO18-208	ENST00000470089	NHS	Q6T4R5	1651 aa		40.01	■■■■■ 4

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