RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1W2PP64 1363 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 MROH1Q8NDA8 1641 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 IFT172Q9UG01 1749 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 CDC45O75419 566 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 GCC1Q96CN9 775 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 DIP2BQ9P265 1576 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 HECW2Q9P2P5 1572 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 ADGRB1O14514 1584 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 TULP4Q9NRJ4 1543 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 LMBRD1Q9NUN5 540 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 IL16Q14005 1332 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 APBB1O00213 710 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 HS1BP3Q53T59 392 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 GGT6Q6P531 493 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 GLI2P10070 1586 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 TSPOAP1O95153 1857 aa16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ALDH1L2Q3SY69 923 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PRKAR2BP31323 418 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF445P59923 1031 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NSD2O96028 1365 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 EFCAB6Q5THR3 1501 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 HMOX1P09601 288 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 FYB1O15117 783 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 GPT2Q8TD30 523 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 UQCRHLA0A096LP55 91 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 UQCRHP07919 91 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF214Q8ND24 703 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ADGRB3O60242 1522 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 YEATS2Q9ULM3 1422 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MED14O60244 1454 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 VAMP4O75379 141 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 RABEP1Q15276 862 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PDLIM2Q96JY6 352 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PHACTR3Q96KR7 559 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 RICTORQ6R327 1708 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SYCE3A1L190 88 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PRDM4Q9UKN5 801 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NUCB2P80303 420 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MAP7D2Q96T17 732 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MPNDQ8N594 471 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM63CQ9P1W3 806 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ZDHHC9Q9Y397 364 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 USP26Q9BXU7 913 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 NPATQ14207 1427 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 TTC22Q5TAA0 569 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 MBIPQ9NS73 344 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 REREQ9P2R6 1566 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCC4O15439 1325 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRC7Q96NW7 1537 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 C8orf58Q8NAV2 365 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 PPLO60437 1756 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 SDSP20132 328 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 PTCH1Q13635 1447 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM83GA6ND36 823 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 FCHSD2O94868 740 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 DCTN1Q14203 1278 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 ST18O60284 1047 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 LRSAM1Q6UWE0 723 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 PIK3R4Q99570 1358 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 MCM5P33992 734 aa16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms