RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468532.5

CHKB-205, Transcript of choline kinase beta, human

TSL 5

Gene CHKB, Length 1,052 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHKB-205	ENST00000468532	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		43.4	■■■■■ 4.54
CHKB-205	ENST00000468532	CRB1	P82279	1406 aa		43.4	■■■■■ 4.54
CHKB-205	ENST00000468532	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		43.4	■■■■■ 4.54
CHKB-205	ENST00000468532	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		43.4	■■■■■ 4.54
CHKB-205	ENST00000468532	CCDC125	Q86Z20	511 aa		43.4	■■■■■ 4.54
CHKB-205	ENST00000468532	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		43.4	■■■■■ 4.54
CHKB-205	ENST00000468532	MYOM1	P52179	1685 aa		43.37	■■■■■ 4.53
CHKB-205	ENST00000468532	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	43.37	■■■■■ 4.53
CHKB-205	ENST00000468532	LTN1	O94822	1766 aa		43.36	■■■■■ 4.53
CHKB-205	ENST00000468532	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	43.36	■■■■■ 4.53
CHKB-205	ENST00000468532	ABCC6	O95255	1503 aa		43.35	■■■■■ 4.53
CHKB-205	ENST00000468532	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	43.35	■■■■■ 4.53
CHKB-205	ENST00000468532	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		43.33	■■■■■ 4.53
CHKB-205	ENST00000468532	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		43.33	■■■■■ 4.53
CHKB-205	ENST00000468532	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	43.32	■■■■■ 4.53
CHKB-205	ENST00000468532	FAM182B	Q5T319	152 aa		43.31	■■■■■ 4.52
CHKB-205	ENST00000468532	COG3	Q96JB2	828 aa		43.29	■■■■■ 4.52
CHKB-205	ENST00000468532	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		43.28	■■■■■ 4.52
CHKB-205	ENST00000468532	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	43.25	■■■■■ 4.51
CHKB-205	ENST00000468532	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	43.24	■■■■■ 4.51
CHKB-205	ENST00000468532	PDE3B	Q13370	1112 aa		43.22	■■■■■ 4.51
CHKB-205	ENST00000468532	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		43.22	■■■■■ 4.51
CHKB-205	ENST00000468532	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		43.22	■■■■■ 4.51
CHKB-205	ENST00000468532	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		43.22	■■■■■ 4.51
CHKB-205	ENST00000468532	FYB1	O15117	783 aa		43.19	■■■■■ 4.5
CHKB-205	ENST00000468532	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		43.19	■■■■■ 4.5
CHKB-205	ENST00000468532	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		43.18	■■■■■ 4.5
CHKB-205	ENST00000468532	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		43.17	■■■■■ 4.5
CHKB-205	ENST00000468532	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		43.16	■■■■■ 4.5
CHKB-205	ENST00000468532	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		43.16	■■■■■ 4.5
CHKB-205	ENST00000468532	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		43.16	■■■■■ 4.5
CHKB-205	ENST00000468532	ERBB3	P21860	1342 aa		43.16	■■■■■ 4.5
CHKB-205	ENST00000468532	LRRC37A3	O60309	1634 aa		43.15	■■■■■ 4.5
CHKB-205	ENST00000468532	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		43.14	■■■■■ 4.5
CHKB-205	ENST00000468532	FBLN1	P23142	703 aa		43.11	■■■■■ 4.49
CHKB-205	ENST00000468532	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		43.11	■■■■■ 4.49
CHKB-205	ENST00000468532	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		43.11	■■■■■ 4.49
CHKB-205	ENST00000468532	CCDC7	Q96M83	1385 aa		43.11	■■■■■ 4.49
CHKB-205	ENST00000468532	IP6K1	Q92551	441 aa		43.1	■■■■■ 4.49
CHKB-205	ENST00000468532	DDB1	Q16531	1140 aa		43.08	■■■■■ 4.49
CHKB-205	ENST00000468532	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	43.08	■■■■■ 4.49
CHKB-205	ENST00000468532	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		43.08	■■■■■ 4.49
CHKB-205	ENST00000468532	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	43.08	■■■■■ 4.49
CHKB-205	ENST00000468532	DISP2	A7MBM2	1401 aa		43.06	■■■■■ 4.48
CHKB-205	ENST00000468532	BAG6	P46379	1132 aa		43.06	■■■■■ 4.48
CHKB-205	ENST00000468532	AMPH	P49418	695 aa		43.04	■■■■■ 4.48
CHKB-205	ENST00000468532	TRIM37	O94972	964 aa		43.03	■■■■■ 4.48
CHKB-205	ENST00000468532	HOXC9	P31274	260 aa		43.02	■■■■■ 4.48
CHKB-205	ENST00000468532	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	43.01	■■■■■ 4.48
CHKB-205	ENST00000468532	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	43.01	■■■■■ 4.48
CHKB-205	ENST00000468532	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	43	■■■■■ 4.47
CHKB-205	ENST00000468532	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		42.99	■■■■■ 4.47
CHKB-205	ENST00000468532	RTL1	A6NKG5	1358 aa		42.99	■■■■■ 4.47
CHKB-205	ENST00000468532	PEAK1	Q9H792	1746 aa		42.99	■■■■■ 4.47
CHKB-205	ENST00000468532	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	42.98	■■■■■ 4.47
CHKB-205	ENST00000468532	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		42.97	■■■■■ 4.47
CHKB-205	ENST00000468532	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	42.94	■■■■■ 4.46
CHKB-205	ENST00000468532	EXOC5	O00471	708 aa		42.92	■■■■■ 4.46
CHKB-205	ENST00000468532	TNS2	Q63HR2	1409 aa		42.91	■■■■■ 4.46
CHKB-205	ENST00000468532	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	42.91	■■■■■ 4.46
CHKB-205	ENST00000468532	PANK3	Q9H999	370 aa		42.91	■■■■■ 4.46
CHKB-205	ENST00000468532	IL2RB	P14784	551 aa		42.9	■■■■■ 4.46
CHKB-205	ENST00000468532	SBF2	Q86WG5	1849 aa		42.89	■■■■■ 4.46
CHKB-205	ENST00000468532	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		42.88	■■■■■ 4.46
CHKB-205	ENST00000468532	APBA3	O96018	575 aa		42.88	■■■■■ 4.45
CHKB-205	ENST00000468532	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		42.87	■■■■■ 4.45
CHKB-205	ENST00000468532	FLT4	P35916	1363 aa		42.84	■■■■■ 4.45
CHKB-205	ENST00000468532	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		42.83	■■■■■ 4.45
CHKB-205	ENST00000468532	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	42.82	■■■■■ 4.45
CHKB-205	ENST00000468532	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		42.82	■■■■■ 4.45
CHKB-205	ENST00000468532	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	42.82	■■■■■ 4.45
CHKB-205	ENST00000468532	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		42.81	■■■■■ 4.44
CHKB-205	ENST00000468532	INSR	P06213	1382 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CHKB-205	ENST00000468532	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CHKB-205	ENST00000468532	BCL9	O00512	1426 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CHKB-205	ENST00000468532	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	42.79	■■■■■ 4.44
CHKB-205	ENST00000468532	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		42.79	■■■■■ 4.44
CHKB-205	ENST00000468532	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		42.76	■■■■■ 4.44
CHKB-205	ENST00000468532	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
CHKB-205	ENST00000468532	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CHKB-205	ENST00000468532	NBPF4	Q96M43	638 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CHKB-205	ENST00000468532	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	42.72	■■■■■ 4.43
CHKB-205	ENST00000468532	NSD2	O96028	1365 aa		42.72	■■■■■ 4.43
CHKB-205	ENST00000468532	RREB1	Q92766	1687 aa		42.71	■■■■■ 4.43
CHKB-205	ENST00000468532	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	42.71	■■■■■ 4.43
CHKB-205	ENST00000468532	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		42.71	■■■■■ 4.43
CHKB-205	ENST00000468532	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		42.7	■■■■■ 4.43
CHKB-205	ENST00000468532	MEGF6	O75095	1541 aa		42.68	■■■■■ 4.42
CHKB-205	ENST00000468532	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		42.68	■■■■■ 4.42
CHKB-205	ENST00000468532	POLK	Q9UBT6	870 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CHKB-205	ENST00000468532	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CHKB-205	ENST00000468532	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	42.65	■■■■■ 4.42
CHKB-205	ENST00000468532	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CHKB-205	ENST00000468532	NHS	Q6T4R5	1651 aa		42.64	■■■■■ 4.42
CHKB-205	ENST00000468532	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		42.64	■■■■■ 4.42
CHKB-205	ENST00000468532	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		42.63	■■■■■ 4.42
CHKB-205	ENST00000468532	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	42.63	■■■■■ 4.41
CHKB-205	ENST00000468532	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	42.63	■■■■■ 4.41
CHKB-205	ENST00000468532	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		42.61	■■■■■ 4.41
CHKB-205	ENST00000468532	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		42.6	■■■■■ 4.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms