RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455407.5

SH3GLB2-208, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3GLB2, Length 837 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2-208ENST00000455407 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP40.21■■■■■ 4.03
SH3GLB2-208ENST00000455407 CD163L1Q9NR16 1453 aa40.2■■■■■ 4.03
SH3GLB2-208ENST00000455407 WDR17Q8IZU2 1322 aa40.2■■■■■ 4.03
SH3GLB2-208ENST00000455407 NFAT5O94916 1531 aa40.2■■■■■ 4.03
SH3GLB2-208ENST00000455407 TERF2IPQ9NYB0 399 aa40.19■■■■■ 4.02
SH3GLB2-208ENST00000455407 SLC24A1O60721 1099 aa40.18■■■■■ 4.02
SH3GLB2-208ENST00000455407 AXIN2Q9Y2T1 843 aa40.18■■■■■ 4.02
SH3GLB2-208ENST00000455407 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa40.17■■■■■ 4.02
SH3GLB2-208ENST00000455407 USP31Q70CQ4 1352 aa40.17■■■■■ 4.02
SH3GLB2-208ENST00000455407 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
SH3GLB2-208ENST00000455407 ABCC6O95255 1503 aa40.15■■■■■ 4.02
SH3GLB2-208ENST00000455407 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
SH3GLB2-208ENST00000455407 USP54Q70EL1 1684 aa40.15■■■■■ 4.02
SH3GLB2-208ENST00000455407 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa40.13■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 APBA3O96018 575 aa40.12■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa40.12■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 PARD3Q8TEW0 1356 aa40.11■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 NINLQ9Y2I6 1382 aa40.11■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 RGPD5Q99666 1765 aa40.11■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 NME9Q86XW9 330 aa40.11■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 TESK2Q96S53 571 aa40.11■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 A0A1W2PP64 1363 aa40.1■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 LRRC37A3O60309 1634 aa40.09■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 DDB1Q16531 1140 aa40.09■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa40.08■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa40.08■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 OVOS2Q6IE36 1432 aa40.08■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 WNK3Q9BYP7 1800 aa40.08■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 CAMKK2Q96RR4 588 aa40.07■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 CARD10Q9BWT7 1032 aa40.07■■■■■ 4.01
SH3GLB2-208ENST00000455407 CCDC7Q96M83 1385 aa40.01■■■■■ 4
SH3GLB2-208ENST00000455407 PEAK1Q9H792 1746 aa40.01■■■■■ 4
SH3GLB2-208ENST00000455407 LRP5O75197 1615 aa40■■■■□ 3.99
SH3GLB2-208ENST00000455407 LTN1O94822 1766 aa40■■■■□ 3.99
SH3GLB2-208ENST00000455407 USP47Q96K76 1375 aa39.99■■■■□ 3.99
SH3GLB2-208ENST00000455407 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
SH3GLB2-208ENST00000455407 RREB1Q92766 1687 aa39.96■■■■□ 3.99
SH3GLB2-208ENST00000455407 TMF1P82094 1093 aa39.95■■■■□ 3.99
SH3GLB2-208ENST00000455407 ERBB3P21860 1342 aa39.94■■■■□ 3.98
SH3GLB2-208ENST00000455407 SBF2Q86WG5 1849 aa39.91■■■■□ 3.98
SH3GLB2-208ENST00000455407 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa39.9■■■■□ 3.98
SH3GLB2-208ENST00000455407 EXOC5O00471 708 aa39.9■■■■□ 3.98
SH3GLB2-208ENST00000455407 NLRP2Q9NX02 1062 aa39.9■■■■□ 3.98
SH3GLB2-208ENST00000455407 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
SH3GLB2-208ENST00000455407 NUP188Q5SRE5 1749 aa39.88■■■■□ 3.98
SH3GLB2-208ENST00000455407 COG3Q96JB2 828 aa39.88■■■■□ 3.97
SH3GLB2-208ENST00000455407 BCL9O00512 1426 aa39.88■■■■□ 3.97
SH3GLB2-208ENST00000455407 NBPF14Q5TI25 921 aa39.87■■■■□ 3.97
SH3GLB2-208ENST00000455407 TNS2Q63HR2 1409 aa39.86■■■■□ 3.97
SH3GLB2-208ENST00000455407 ANKRD24Q8TF21 1146 aa39.86■■■■□ 3.97
SH3GLB2-208ENST00000455407 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
SH3GLB2-208ENST00000455407 CDCA8Q53HL2 280 aa39.85■■■■□ 3.97
SH3GLB2-208ENST00000455407 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
SH3GLB2-208ENST00000455407 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa39.84■■■■□ 3.97
SH3GLB2-208ENST00000455407 PLSCR1O15162 318 aa39.81■■■■□ 3.96
SH3GLB2-208ENST00000455407 IP6K1Q92551 441 aa39.8■■■■□ 3.96
SH3GLB2-208ENST00000455407 IL2RBP14784 551 aa39.79■■■■□ 3.96
SH3GLB2-208ENST00000455407 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
SH3GLB2-208ENST00000455407 MAP3K19Q56UN5 1328 aa39.72■■■■□ 3.95
SH3GLB2-208ENST00000455407 PTF1AQ7RTS3 328 aa39.72■■■■□ 3.95
SH3GLB2-208ENST00000455407 AMPHP49418 695 aa39.71■■■■□ 3.95
SH3GLB2-208ENST00000455407 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
SH3GLB2-208ENST00000455407 FYB1O15117 783 aa39.68■■■■□ 3.94
SH3GLB2-208ENST00000455407 HOXC9P31274 260 aa39.67■■■■□ 3.94
SH3GLB2-208ENST00000455407 GGNBP2Q9H3C7 697 aa39.66■■■■□ 3.94
SH3GLB2-208ENST00000455407 RTL1A6NKG5 1358 aa39.66■■■■□ 3.94
SH3GLB2-208ENST00000455407 NHSQ6T4R5 1651 aa39.65■■■■□ 3.94
SH3GLB2-208ENST00000455407 KIF20BQ96Q89 1820 aa39.63■■■■□ 3.93
SH3GLB2-208ENST00000455407 FBLN1P23142 703 aa39.62■■■■□ 3.93
SH3GLB2-208ENST00000455407 MYOM1P52179 1685 aa39.6■■■■□ 3.93
SH3GLB2-208ENST00000455407 KCNQ2O43526 872 aa39.59■■■■□ 3.93
SH3GLB2-208ENST00000455407 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
SH3GLB2-208ENST00000455407 ACSBG1Q96GR2 724 aa39.58■■■■□ 3.93
SH3GLB2-208ENST00000455407 TXNRD1Q16881 649 aa39.57■■■■□ 3.93
SH3GLB2-208ENST00000455407 PROM2Q8N271 834 aa39.57■■■■□ 3.93
SH3GLB2-208ENST00000455407 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
SH3GLB2-208ENST00000455407 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
SH3GLB2-208ENST00000455407 SPON1Q9HCB6 807 aa39.53■■■■□ 3.92
SH3GLB2-208ENST00000455407 NSD3Q9BZ95 1437 aa39.53■■■■□ 3.92
SH3GLB2-208ENST00000455407 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
SH3GLB2-208ENST00000455407 CARD14Q9BXL6 1004 aa39.51■■■■□ 3.92
SH3GLB2-208ENST00000455407 RGPD2P0DJD1 1756 aa39.5■■■■□ 3.91
SH3GLB2-208ENST00000455407 KIF24Q5T7B8 1368 aa39.49■■■■□ 3.91
SH3GLB2-208ENST00000455407 STK32BQ9NY57 414 aa39.49■■■■□ 3.91
SH3GLB2-208ENST00000455407 BTAF1O14981 1849 aa39.48■■■■□ 3.91
SH3GLB2-208ENST00000455407 FLT4P35916 1363 aa39.47■■■■□ 3.91
SH3GLB2-208ENST00000455407 KAT6BQ8WYB5 2073 aa39.47■■■■□ 3.91
SH3GLB2-208ENST00000455407 INSRP06213 1382 aa39.46■■■■□ 3.91
SH3GLB2-208ENST00000455407 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
SH3GLB2-208ENST00000455407 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP39.44■■■■□ 3.9
SH3GLB2-208ENST00000455407 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
SH3GLB2-208ENST00000455407 MEGF6O75095 1541 aa39.44■■■■□ 3.9
SH3GLB2-208ENST00000455407 CASZ1Q86V15 1759 aa39.44■■■■□ 3.9
SH3GLB2-208ENST00000455407 NBPF6Q5VWK0 638 aa39.43■■■■□ 3.9
SH3GLB2-208ENST00000455407 NBPF4Q96M43 638 aa39.43■■■■□ 3.9
SH3GLB2-208ENST00000455407 POLR3GLQ9BT43 218 aa39.43■■■■□ 3.9
SH3GLB2-208ENST00000455407 CGNL1Q0VF96 1302 aa39.42■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms