RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455235.5

ZDHHC3-208, Transcript of zinc finger DHHC-type containing 3, human

TSL 4

Gene ZDHHC3, Length 537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		33.57	■■■□□ 2.96
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CRB1	P82279	1406 aa		33.56	■■■□□ 2.96
ZDHHC3-208	ENST00000455235	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	33.56	■■■□□ 2.96
ZDHHC3-208	ENST00000455235	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		33.56	■■■□□ 2.96
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		33.55	■■■□□ 2.96
ZDHHC3-208	ENST00000455235	EVA1C	P58658	441 aa		33.55	■■■□□ 2.96
ZDHHC3-208	ENST00000455235	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
ZDHHC3-208	ENST00000455235	COG3	Q96JB2	828 aa		33.55	■■■□□ 2.96
ZDHHC3-208	ENST00000455235	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	33.53	■■■□□ 2.96
ZDHHC3-208	ENST00000455235	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		33.52	■■■□□ 2.96
ZDHHC3-208	ENST00000455235	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		33.51	■■■□□ 2.96
ZDHHC3-208	ENST00000455235	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		33.51	■■■□□ 2.95
ZDHHC3-208	ENST00000455235	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		33.5	■■■□□ 2.95
ZDHHC3-208	ENST00000455235	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		33.49	■■■□□ 2.95
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		33.49	■■■□□ 2.95
ZDHHC3-208	ENST00000455235	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		33.49	■■■□□ 2.95
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
ZDHHC3-208	ENST00000455235	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
ZDHHC3-208	ENST00000455235	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		33.47	■■■□□ 2.95
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ERBB3	P21860	1342 aa		33.44	■■■□□ 2.94
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		33.44	■■■□□ 2.94
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.44	■■■□□ 2.94
ZDHHC3-208	ENST00000455235	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
ZDHHC3-208	ENST00000455235	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		33.43	■■■□□ 2.94
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RTL1	A6NKG5	1358 aa		33.43	■■■□□ 2.94
ZDHHC3-208	ENST00000455235	USP35	Q9P2H5	1018 aa		33.42	■■■□□ 2.94
ZDHHC3-208	ENST00000455235	EP400	Q96L91	3159 aa		33.42	■■■□□ 2.94
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PANK3	Q9H999	370 aa		33.41	■■■□□ 2.94
ZDHHC3-208	ENST00000455235		A0A0G2JS52	829 aa		33.4	■■■□□ 2.94
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MYT1	Q01538	1121 aa		33.4	■■■□□ 2.94
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		33.4	■■■□□ 2.94
ZDHHC3-208	ENST00000455235	IP6K1	Q92551	441 aa		33.4	■■■□□ 2.94
ZDHHC3-208	ENST00000455235	LRRC37A3	O60309	1634 aa		33.39	■■■□□ 2.94
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		33.39	■■■□□ 2.94
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PEAK1	Q9H792	1746 aa		33.39	■■■□□ 2.94
ZDHHC3-208	ENST00000455235	DISP2	A7MBM2	1401 aa		33.38	■■■□□ 2.93
ZDHHC3-208	ENST00000455235	FBLN1	P23142	703 aa		33.38	■■■□□ 2.93
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CCDC7	Q96M83	1385 aa		33.37	■■■□□ 2.93
ZDHHC3-208	ENST00000455235	NSD2	O96028	1365 aa		33.35	■■■□□ 2.93
ZDHHC3-208	ENST00000455235	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		33.35	■■■□□ 2.93
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		33.34	■■■□□ 2.93
ZDHHC3-208	ENST00000455235	HOXC9	P31274	260 aa		33.34	■■■□□ 2.93
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ZDHHC3-208	ENST00000455235	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		33.32	■■■□□ 2.93
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
ZDHHC3-208	ENST00000455235	AMPH	P49418	695 aa		33.29	■■■□□ 2.92
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CCDC125	Q86Z20	511 aa		33.29	■■■□□ 2.92
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
ZDHHC3-208	ENST00000455235	FLT4	P35916	1363 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ZDHHC3-208	ENST00000455235	INSR	P06213	1382 aa		33.26	■■■□□ 2.92
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		33.26	■■■□□ 2.92
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		33.26	■■■□□ 2.91
ZDHHC3-208	ENST00000455235	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		33.24	■■■□□ 2.91
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TNS2	Q63HR2	1409 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ZDHHC3-208	ENST00000455235	FAM182B	Q5T319	152 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ZDHHC3-208	ENST00000455235	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ZDHHC3-208	ENST00000455235	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
ZDHHC3-208	ENST00000455235	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
ZDHHC3-208	ENST00000455235	DDB1	Q16531	1140 aa		33.19	■■■□□ 2.9
ZDHHC3-208	ENST00000455235	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		33.18	■■■□□ 2.9
ZDHHC3-208	ENST00000455235	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
ZDHHC3-208	ENST00000455235	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		33.18	■■■□□ 2.9
ZDHHC3-208	ENST00000455235	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ZDHHC3-208	ENST00000455235	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ZDHHC3-208	ENST00000455235	BCL9	O00512	1426 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SBF2	Q86WG5	1849 aa		33.14	■■■□□ 2.9
ZDHHC3-208	ENST00000455235	NCAPD2	Q15021	1401 aa		33.14	■■■□□ 2.9
ZDHHC3-208	ENST00000455235	IL2RB	P14784	551 aa		33.14	■■■□□ 2.9
ZDHHC3-208	ENST00000455235	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		33.13	■■■□□ 2.89
ZDHHC3-208	ENST00000455235	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
ZDHHC3-208	ENST00000455235	NBPF4	Q96M43	638 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MEGF6	O75095	1541 aa		33.09	■■■□□ 2.89
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		33.09	■■■□□ 2.89
ZDHHC3-208	ENST00000455235	EXOC5	O00471	708 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
ZDHHC3-208	ENST00000455235	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TRIM37	O94972	964 aa		33.03	■■■□□ 2.88
ZDHHC3-208	ENST00000455235	BAG6	P46379	1132 aa		33.01	■■■□□ 2.87
ZDHHC3-208	ENST00000455235	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		33	■■■□□ 2.87
ZDHHC3-208	ENST00000455235	NHS	Q6T4R5	1651 aa		33	■■■□□ 2.87
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		32.99	■■■□□ 2.87
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.99	■■■□□ 2.87
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
ZDHHC3-208	ENST00000455235	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RREB1	Q92766	1687 aa		32.96	■■■□□ 2.87
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
ZDHHC3-208	ENST00000455235	EYA1	Q99502	592 aa		32.95	■■■□□ 2.87
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		32.94	■■■□□ 2.86
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		32.93	■■■□□ 2.86

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1571 ms