RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDE3BQ13370 1112 aa8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 STRN4Q9NRL3 753 aa8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 CASZ1Q86V15 1759 aa8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTGER2P43116 358 aa8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHRNA2Q15822 529 aa8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 BARGINQ6ZT62 677 aa8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRS2Q9HD23 443 aa8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP35Q9P2H5 1018 aa8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYOM1P52179 1685 aa8.53□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZBTB7AO95365 584 aa8.53□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIAA0232Q92628 1395 aa8.53□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 SYT17Q9BSW7 474 aa8.53□□□□□ -1.04
SHQ1P1-201ENST00000437111 PIK3C2GO75747 1445 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 RGL3Q3MIN7 710 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHD4Q14839 1912 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLSCR1O15162 318 aa8.51□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC24A1O60721 1099 aa8.51□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRAM1Q96QH2 718 aa8.51□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.51□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 CEP350Q5VT06 3117 aa8.51□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 SSH2Q76I76 1423 aa8.51□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 RALBP1Q15311 655 aa8.5□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.5□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.5□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDCA8Q53HL2 280 aa8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 EVA1CP58658 441 aa8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMF1P82094 1093 aa8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTF1AQ7RTS3 328 aa8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.48□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 PEAK1Q9H792 1746 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 DLC1Q96QB1 1528 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 POGKQ9P215 609 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 PITPNM1O00562 1244 aa8.46□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.46□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.46□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 MTFR1LQ9H019 292 aa8.46□□□□□ -1.05
SHQ1P1-201ENST00000437111 TULP4Q9NRJ4 1543 aa8.46□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC15A2Q16348 729 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMC1Q8TDI8 760 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARXQ96QS3 562 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 STK32BQ9NY57 414 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 SBF2Q86WG5 1849 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 LMO7Q8WWI1 1683 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 INSRP06213 1382 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAP3K5Q99683 1374 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 QRICH2Q9H0J4 1663 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPR162Q16538 588 aa8.44□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 TXNRD1Q16881 649 aa8.44□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.44□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP7BP35670 1465 aa8.44□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 POTEHQ6S545 545 aa8.44□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 NLRP13Q86W25 1043 aa8.44□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXO3Q9UK99 471 aa8.44□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 CPDO75976 1380 aa8.43□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC37A3O60309 1634 aa8.42□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 DDB1Q16531 1140 aa8.42□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.42□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 CRB1P82279 1406 aa8.42□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP19O94966 1318 aa8.42□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 BCL9O00512 1426 aa8.41□□□□□ -1.06
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