RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF24Q5T7B8 1368 aa4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 SIRT1Q96EB6 747 aa4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 DIP2AQ14689 1571 aa4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 DDX19BQ9UMR2 479 aa4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 RTL1A6NKG5 1358 aa4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 CHL1O00533 1208 aa4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 DCTPP1Q9H773 170 aa4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF16BQ96L93 1317 aa4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 MYH16Q9H6N6 1097 aa4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF20BQ96Q89 1820 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 NEUROD2Q15784 382 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 MBIPQ9NS73 344 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 C8orf58Q8NAV2 365 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 DIP2BQ9P265 1576 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 IL25Q9H293 177 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 USP54Q70EL1 1684 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 GAS2L2Q8NHY3 880 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R9BQ96SB3 815 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 OSBPL3Q9H4L5 887 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 AKAP12Q02952 1782 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 NCAPD2Q15021 1401 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 PKP1Q13835 747 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 ZRANB1Q9UGI0 708 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAM1Q96QH2 718 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 CABP1Q9NZU7 370 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP44Q96MT7 982 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 CHMP5Q9NZZ3 219 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 CHD1LQ86WJ1 897 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 RIMS2Q9UQ26 1411 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 ROBO2Q9HCK4 1378 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP23Q9P227 1491 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKAR2BP31323 418 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 NFE2L2Q16236 605 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 GGT6Q6P531 493 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRUQ92729 1446 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT24Q2M2I5 525 aa4.59□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 RIPK4P57078 832 aa4.59□□□□□ -1.67
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD44Q8N8A2 993 aa4.59□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 IFT57Q9NWB7 429 aa4.59□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHG3A1L390 1219 aa4.59□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAK2O60296 914 aa4.59□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 AEBP1Q8IUX7 1158 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 USP26Q9BXU7 913 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 NME9Q86XW9 330 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 LNPKQ9C0E8 428 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 SMC4Q9NTJ3 1288 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM83GA6ND36 823 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 CHAMP1Q96JM3 812 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF445P59923 1031 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 CUL4AQ13619 759 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL40Q2TBA0 621 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 WAPLQ7Z5K2 1190 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK19Q9BWU1 502 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP85Q6P2H3 762 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 GCC1Q96CN9 775 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 USP6P35125 1406 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP53Q96M91 514 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 HEG1Q9ULI3 1381 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 ESPNB1AK53 854 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 WASLO00401 505 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 MRE11P49959 708 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 SSFA2P28290 1259 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC22Q5TAA0 569 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 IGSF1Q8N6C5 1336 aa4.56□□□□□ -1.68
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