RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.84■■□□□ 1.57
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SEMA3B-201ENST00000416295 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.83■■□□□ 1.56
SEMA3B-201ENST00000416295 COL18A1P39060 1754 aa24.82■■□□□ 1.56
SEMA3B-201ENST00000416295 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.82■■□□□ 1.56
SEMA3B-201ENST00000416295 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.82■■□□□ 1.56
SEMA3B-201ENST00000416295 PANK3Q9H999 370 aa24.82■■□□□ 1.56
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SEMA3B-201ENST00000416295 MYT1Q01538 1121 aa24.78■■□□□ 1.56
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SEMA3B-201ENST00000416295 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.77■■□□□ 1.56
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SEMA3B-201ENST00000416295 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.75■■□□□ 1.55
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SEMA3B-201ENST00000416295 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.74■■□□□ 1.55
SEMA3B-201ENST00000416295 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.74■■□□□ 1.55
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SEMA3B-201ENST00000416295 RTL1A6NKG5 1358 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-201ENST00000416295 ERBB3P21860 1342 aa24.72■■□□□ 1.55
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SEMA3B-201ENST00000416295 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA3B-201ENST00000416295 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
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SEMA3B-201ENST00000416295 FBLN1P23142 703 aa24.7■■□□□ 1.54
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SEMA3B-201ENST00000416295 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA3B-201ENST00000416295 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA3B-201ENST00000416295 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.68■■□□□ 1.54
SEMA3B-201ENST00000416295 HOXC9P31274 260 aa24.68■■□□□ 1.54
SEMA3B-201ENST00000416295 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.67■■□□□ 1.54
SEMA3B-201ENST00000416295 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SEMA3B-201ENST00000416295 FLT4P35916 1363 aa24.65■■□□□ 1.54
SEMA3B-201ENST00000416295 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.64■■□□□ 1.54
SEMA3B-201ENST00000416295 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
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SEMA3B-201ENST00000416295 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-201ENST00000416295 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-201ENST00000416295 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-201ENST00000416295 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-201ENST00000416295 INSRP06213 1382 aa24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-201ENST00000416295 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-201ENST00000416295 PDE3BQ13370 1112 aa24.6■■□□□ 1.53
SEMA3B-201ENST00000416295 MORC1Q86VD1 984 aa24.6■■□□□ 1.53
SEMA3B-201ENST00000416295 PEAK1Q9H792 1746 aa24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-201ENST00000416295 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-201ENST00000416295 DISP2A7MBM2 1401 aa24.59■■□□□ 1.53
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SEMA3B-201ENST00000416295 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-201ENST00000416295 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-201ENST00000416295 BAG6P46379 1132 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-201ENST00000416295 DDB1Q16531 1140 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-201ENST00000416295 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-201ENST00000416295 POLKQ9UBT6 870 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-201ENST00000416295 LRRC37A3O60309 1634 aa24.56■■□□□ 1.52
SEMA3B-201ENST00000416295 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.55■■□□□ 1.52
SEMA3B-201ENST00000416295 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.55■■□□□ 1.52
SEMA3B-201ENST00000416295 IL2RBP14784 551 aa24.54■■□□□ 1.52
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM182BQ5T319 152 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-201ENST00000416295 TNS2Q63HR2 1409 aa24.52■■□□□ 1.52
SEMA3B-201ENST00000416295 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SEMA3B-201ENST00000416295 EXOC5O00471 708 aa24.51■■□□□ 1.51
SEMA3B-201ENST00000416295 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
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SEMA3B-201ENST00000416295 NBPF4Q96M43 638 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-201ENST00000416295 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.49■■□□□ 1.51
SEMA3B-201ENST00000416295 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.47■■□□□ 1.51
SEMA3B-201ENST00000416295 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.45■■□□□ 1.5
SEMA3B-201ENST00000416295 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
SEMA3B-201ENST00000416295 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.44■■□□□ 1.5
SEMA3B-201ENST00000416295 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
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SEMA3B-201ENST00000416295 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SEMA3B-201ENST00000416295 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
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SEMA3B-201ENST00000416295 MEGF6O75095 1541 aa24.42■■□□□ 1.5
SEMA3B-201ENST00000416295 NCAPD2Q15021 1401 aa24.42■■□□□ 1.5
SEMA3B-201ENST00000416295 TRIM37O94972 964 aa24.41■■□□□ 1.5
SEMA3B-201ENST00000416295 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SEMA3B-201ENST00000416295 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.41■■□□□ 1.5
SEMA3B-201ENST00000416295 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SEMA3B-201ENST00000416295 MTHFSP49914 203 aa24.4■■□□□ 1.5
SEMA3B-201ENST00000416295 EYA1Q99502 592 aa24.4■■□□□ 1.5
SEMA3B-201ENST00000416295 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SEMA3B-201ENST00000416295 APBA3O96018 575 aa24.36■■□□□ 1.49
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