RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-202ENST00000414620 DISP2A7MBM2 1401 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-202ENST00000414620 KCNH5Q8NCM2 988 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-202ENST00000414620 RREB1Q92766 1687 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-202ENST00000414620 PEAK1Q9H792 1746 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-202ENST00000414620 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ACTB-202ENST00000414620 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-202ENST00000414620 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-202ENST00000414620 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-202ENST00000414620 NME9Q86XW9 330 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-202ENST00000414620 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
ACTB-202ENST00000414620 LRP5O75197 1615 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-202ENST00000414620 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-202ENST00000414620 A0A1W2PP64 1363 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-202ENST00000414620 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-202ENST00000414620 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-202ENST00000414620 APBA3O96018 575 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-202ENST00000414620 USP31Q70CQ4 1352 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-202ENST00000414620 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
ACTB-202ENST00000414620 ABCC6O95255 1503 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-202ENST00000414620 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-202ENST00000414620 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-202ENST00000414620 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-202ENST00000414620 TESK2Q96S53 571 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-202ENST00000414620 DDB1Q16531 1140 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-202ENST00000414620 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-202ENST00000414620 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ACTB-202ENST00000414620 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-202ENST00000414620 USP47Q96K76 1375 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-202ENST00000414620 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-202ENST00000414620 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-202ENST00000414620 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ACTB-202ENST00000414620 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-202ENST00000414620 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ACTB-202ENST00000414620 CCDC7Q96M83 1385 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-202ENST00000414620 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-202ENST00000414620 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-202ENST00000414620 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-202ENST00000414620 ERBB3P21860 1342 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-202ENST00000414620 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ACTB-202ENST00000414620 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ACTB-202ENST00000414620 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-202ENST00000414620 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ACTB-202ENST00000414620 TNS2Q63HR2 1409 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-202ENST00000414620 MYOM1P52179 1685 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-202ENST00000414620 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ACTB-202ENST00000414620 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-202ENST00000414620 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-202ENST00000414620 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-202ENST00000414620 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-202ENST00000414620 TMF1P82094 1093 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-202ENST00000414620 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-202ENST00000414620 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-202ENST00000414620 NHSQ6T4R5 1651 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-202ENST00000414620 EXOC5O00471 708 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-202ENST00000414620 SLC24A1O60721 1099 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-202ENST00000414620 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
ACTB-202ENST00000414620 COG3Q96JB2 828 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-202ENST00000414620 FBLN1P23142 703 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-202ENST00000414620 NBPF14Q5TI25 921 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-202ENST00000414620 BCL9O00512 1426 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-202ENST00000414620 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-202ENST00000414620 IL2RBP14784 551 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-202ENST00000414620 BTAF1O14981 1849 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-202ENST00000414620 IP6K1Q92551 441 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-202ENST00000414620 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-202ENST00000414620 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-202ENST00000414620 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-202ENST00000414620 PLSCR1O15162 318 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-202ENST00000414620 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-202ENST00000414620 HOXC9P31274 260 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-202ENST00000414620 AMPHP49418 695 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-202ENST00000414620 CASZ1Q86V15 1759 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-202ENST00000414620 KCNQ2O43526 872 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-202ENST00000414620 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
ACTB-202ENST00000414620 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
ACTB-202ENST00000414620 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-202ENST00000414620 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-202ENST00000414620 FYB1O15117 783 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-202ENST00000414620 CDCA8Q53HL2 280 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-202ENST00000414620 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-202ENST00000414620 PROM2Q8N271 834 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-202ENST00000414620 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-202ENST00000414620 RTL1A6NKG5 1358 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-202ENST00000414620 TXNRD1Q16881 649 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-202ENST00000414620 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-202ENST00000414620 MEGF6O75095 1541 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-202ENST00000414620 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
ACTB-202ENST00000414620 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
ACTB-202ENST00000414620 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-202ENST00000414620 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-202ENST00000414620 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-202ENST00000414620 PAPPAQ13219 1627 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-202ENST00000414620 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
ACTB-202ENST00000414620 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ACTB-202ENST00000414620 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-202ENST00000414620 SPON1Q9HCB6 807 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-202ENST00000414620 STK32BQ9NY57 414 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-202ENST00000414620 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-202ENST00000414620 NBPF4Q96M43 638 aa21.58■■□□□ 1.05
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