RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411265.1

RNU6-1001P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1001, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1001P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1001P-201ENST00000411265 POTECB2RU33 542 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 UPP2O95045 317 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NR3C2P08235 984 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GRM5P41594 1212 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRIM52Q96A61 297 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZBBXA8MT70 800 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
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RNU6-1001P-201ENST00000411265 ITPKCQ96DU7 683 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRIM46Q7Z4K8 759 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MEIOBQ8N635 442 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OCSTAMPQ9BR26 566 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SEPT12Q8IYM1 358 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FBXO45P0C2W1 286 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NR1H3Q13133 447 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CCDC125Q86Z20 511 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZFP42Q96MM3 310 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BMP2P12643 396 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SNRKQ9NRH2 765 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RAB15P59190 212 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C6orf118Q5T5N4 469 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RNF20Q5VTR2 975 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ESPNB1AK53 854 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 Q6ZVU0 165 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ERVH48-1M5A8F1 160 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MAN1A2O60476 641 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GPR37L1O60883 481 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MCM6Q14566 821 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TREML4Q6UXN2 200 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NPAS3Q8IXF0 933 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC16A10Q8TF71 515 aa4.99□□□□□ -1.61
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RNU6-1001P-201ENST00000411265 ADH1AP07327 375 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP4.98□□□□□ -1.61
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RNU6-1001P-201ENST00000411265 WWC1Q8IX03 1113 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TTLL8A6PVC2 850 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SPINT1O43278 529 aa4.97□□□□□ -1.61
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RNU6-1001P-201ENST00000411265 WASHC4Q2M389 1173 aa4.97□□□□□ -1.61
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RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
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RNU6-1001P-201ENST00000411265 AGBL1Q96MI9 1066 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GDPD2Q9HCC8 539 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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RNU6-1001P-201ENST00000411265 LILRA1O75019 489 aa4.94□□□□□ -1.62
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RNU6-1001P-201ENST00000411265 ERVK-9P63128 1117 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IRF5Q13568 498 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 H3BM21 787 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MYCP01106 439 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 VAC14Q08AM6 782 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLFNL1Q499Z3 407 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CEP126Q9P2H0 1117 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 UBTFP17480 764 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SEMA3FQ13275 785 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RNF135Q8IUD6 432 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RNF217Q8TC41 542 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DOLKQ9UPQ8 538 aa4.92□□□□□ -1.62
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