RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399336.8

NOMO3-202, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 4,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-202ENST00000399336 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.23■■□□□ 1.15
NOMO3-202ENST00000399336 SEC24BO95487 1268 aa22.22■■□□□ 1.15
NOMO3-202ENST00000399336 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.22■■□□□ 1.15
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NOMO3-202ENST00000399336 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.21■■□□□ 1.15
NOMO3-202ENST00000399336 MBIPQ9NS73 344 aa22.21■■□□□ 1.15
NOMO3-202ENST00000399336 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NOMO3-202ENST00000399336 CNTROBQ8N137 903 aa22.21■■□□□ 1.15
NOMO3-202ENST00000399336 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.21■■□□□ 1.15
NOMO3-202ENST00000399336 FOSBP53539 338 aa22.21■■□□□ 1.15
NOMO3-202ENST00000399336 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NOMO3-202ENST00000399336 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
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NOMO3-202ENST00000399336 RNF20Q5VTR2 975 aa22.2■■□□□ 1.14
NOMO3-202ENST00000399336 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
NOMO3-202ENST00000399336 KIF3AQ9Y496 699 aa22.2■■□□□ 1.14
NOMO3-202ENST00000399336 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.2■■□□□ 1.14
NOMO3-202ENST00000399336 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NOMO3-202ENST00000399336 ASXL2Q76L83 1435 aa22.19■■□□□ 1.14
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NOMO3-202ENST00000399336 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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NOMO3-202ENST00000399336 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.18■■□□□ 1.14
NOMO3-202ENST00000399336 BICD2Q8TD16 824 aa22.17■■□□□ 1.14
NOMO3-202ENST00000399336 EVA1CP58658 441 aa22.17■■□□□ 1.14
NOMO3-202ENST00000399336 SIL1Q9H173 461 aa22.17■■□□□ 1.14
NOMO3-202ENST00000399336 PIK3C2GO75747 1445 aa22.17■■□□□ 1.14
NOMO3-202ENST00000399336 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.17■■□□□ 1.14
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NOMO3-202ENST00000399336 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.15■■□□□ 1.14
NOMO3-202ENST00000399336 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NOMO3-202ENST00000399336 PBRM1Q86U86 1689 aa22.14■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 BECN2A8MW95 431 aa22.14■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 POLKQ9UBT6 870 aa22.14■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.14■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 MCM2P49736 904 aa22.13■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 TSPYL6Q8N831 410 aa22.13■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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NOMO3-202ENST00000399336 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.13■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.13■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.13■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.12■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.12■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 APPP05067 770 aa22.12■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 ATF3P18847 181 aa22.12■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.12■■□□□ 1.13
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NOMO3-202ENST00000399336 MBD3O95983 291 aa22.1■■□□□ 1.13
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NOMO3-202ENST00000399336 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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NOMO3-202ENST00000399336 KRT24Q2M2I5 525 aa22.09■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.09■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 CPLX1O14810 134 aa22.08■■□□□ 1.13
NOMO3-202ENST00000399336 NUCB1Q02818 461 aa22.08■■□□□ 1.13
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NOMO3-202ENST00000399336 MBD5Q9P267 1494 aa22.08■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 BTBD11A6QL63 1104 aa22.08■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 MX1P20591 662 aa22.08■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 ACEP12821 1306 aa22.08■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.08■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 A0A1W2PP64 1363 aa22.07■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 TPM4P67936 248 aa22.07■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 MEIS3Q99687 375 aa22.07■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 CEP170Q5SW79 1584 aa22.06■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.06■■□□□ 1.12
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NOMO3-202ENST00000399336 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.06■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 AACSQ86V21 672 aa22.05■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 FLIIQ13045 1269 aa22.04■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 VAMP4O75379 141 aa22.04■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 STK3Q13188 491 aa22.04■■□□□ 1.12
NOMO3-202ENST00000399336 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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