RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392991.8

OLFM1-208, Transcript of olfactomedin 1, human

TSL 2 BASIC

Gene OLFM1, Length 1,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
OLFM1-208	ENST00000392991	ABCC6	O95255	1503 aa		43.95	■■■■■ 4.63
OLFM1-208	ENST00000392991	LTN1	O94822	1766 aa		43.95	■■■■■ 4.63
OLFM1-208	ENST00000392991	EVA1C	P58658	441 aa		43.92	■■■■■ 4.62
OLFM1-208	ENST00000392991	CCDC7	Q96M83	1385 aa		43.92	■■■■■ 4.62
OLFM1-208	ENST00000392991	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	43.91	■■■■■ 4.62
OLFM1-208	ENST00000392991	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		43.89	■■■■■ 4.62
OLFM1-208	ENST00000392991	RGPD5	Q99666	1765 aa		43.89	■■■■■ 4.62
OLFM1-208	ENST00000392991	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	43.88	■■■■■ 4.62
OLFM1-208	ENST00000392991	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		43.88	■■■■■ 4.61
OLFM1-208	ENST00000392991	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		43.88	■■■■■ 4.61
OLFM1-208	ENST00000392991	FBLN1	P23142	703 aa		43.85	■■■■■ 4.61
OLFM1-208	ENST00000392991	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	43.84	■■■■■ 4.61
OLFM1-208	ENST00000392991	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		43.82	■■■■■ 4.61
OLFM1-208	ENST00000392991	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		43.81	■■■■■ 4.6
OLFM1-208	ENST00000392991	CRB1	P82279	1406 aa		43.81	■■■■■ 4.6
OLFM1-208	ENST00000392991	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		43.8	■■■■■ 4.6
OLFM1-208	ENST00000392991	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		43.79	■■■■■ 4.6
OLFM1-208	ENST00000392991	USP35	Q9P2H5	1018 aa		43.79	■■■■■ 4.6
OLFM1-208	ENST00000392991	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		43.78	■■■■■ 4.6
OLFM1-208	ENST00000392991	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		43.77	■■■■■ 4.6
OLFM1-208	ENST00000392991	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	43.74	■■■■■ 4.59
OLFM1-208	ENST00000392991	IP6K1	Q92551	441 aa		43.74	■■■■■ 4.59
OLFM1-208	ENST00000392991	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	43.73	■■■■■ 4.59
OLFM1-208	ENST00000392991	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		43.73	■■■■■ 4.59
OLFM1-208	ENST00000392991	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		43.72	■■■■■ 4.59
OLFM1-208	ENST00000392991	ERBB3	P21860	1342 aa		43.72	■■■■■ 4.59
OLFM1-208	ENST00000392991	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		43.71	■■■■■ 4.59
OLFM1-208	ENST00000392991		A0A0G2JS52	829 aa		43.7	■■■■■ 4.59
OLFM1-208	ENST00000392991	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		43.7	■■■■■ 4.59
OLFM1-208	ENST00000392991	MYT1	Q01538	1121 aa		43.7	■■■■■ 4.59
OLFM1-208	ENST00000392991	RTL1	A6NKG5	1358 aa		43.69	■■■■■ 4.59
OLFM1-208	ENST00000392991	NSD2	O96028	1365 aa		43.69	■■■■■ 4.59
OLFM1-208	ENST00000392991	HOXC9	P31274	260 aa		43.69	■■■■■ 4.58
OLFM1-208	ENST00000392991	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	43.69	■■■■■ 4.58
OLFM1-208	ENST00000392991	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		43.68	■■■■■ 4.58
OLFM1-208	ENST00000392991	PEAK1	Q9H792	1746 aa		43.68	■■■■■ 4.58
OLFM1-208	ENST00000392991	AMPH	P49418	695 aa		43.67	■■■■■ 4.58
OLFM1-208	ENST00000392991	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	43.66	■■■■■ 4.58
OLFM1-208	ENST00000392991	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		43.66	■■■■■ 4.58
OLFM1-208	ENST00000392991	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	43.64	■■■■■ 4.58
OLFM1-208	ENST00000392991	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		43.64	■■■■■ 4.58
OLFM1-208	ENST00000392991	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	43.63	■■■■■ 4.57
OLFM1-208	ENST00000392991	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		43.62	■■■■■ 4.57
OLFM1-208	ENST00000392991	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		43.61	■■■■■ 4.57
OLFM1-208	ENST00000392991	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	43.6	■■■■■ 4.57
OLFM1-208	ENST00000392991	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		43.6	■■■■■ 4.57
OLFM1-208	ENST00000392991	EP400	Q96L91	3159 aa		43.6	■■■■■ 4.57
OLFM1-208	ENST00000392991	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		43.59	■■■■■ 4.57
OLFM1-208	ENST00000392991	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	43.58	■■■■■ 4.57
OLFM1-208	ENST00000392991	FLT4	P35916	1363 aa		43.57	■■■■■ 4.57
OLFM1-208	ENST00000392991	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	43.57	■■■■■ 4.57
OLFM1-208	ENST00000392991	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	43.57	■■■■■ 4.57
OLFM1-208	ENST00000392991	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		43.56	■■■■■ 4.56
OLFM1-208	ENST00000392991	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	43.55	■■■■■ 4.56
OLFM1-208	ENST00000392991	DISP2	A7MBM2	1401 aa		43.55	■■■■■ 4.56
OLFM1-208	ENST00000392991	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	43.53	■■■■■ 4.56
OLFM1-208	ENST00000392991	POLK	Q9UBT6	870 aa		43.53	■■■■■ 4.56
OLFM1-208	ENST00000392991	INSR	P06213	1382 aa		43.53	■■■■■ 4.56
OLFM1-208	ENST00000392991	LRRC37A3	O60309	1634 aa		43.52	■■■■■ 4.56
OLFM1-208	ENST00000392991	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		43.52	■■■■■ 4.56
OLFM1-208	ENST00000392991	MORC1	Q86VD1	984 aa		43.51	■■■■■ 4.56
OLFM1-208	ENST00000392991	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		43.46	■■■■■ 4.55
OLFM1-208	ENST00000392991	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	43.46	■■■■■ 4.55
OLFM1-208	ENST00000392991	FAM182B	Q5T319	152 aa		43.46	■■■■■ 4.55
OLFM1-208	ENST00000392991	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	43.45	■■■■■ 4.55
OLFM1-208	ENST00000392991	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	43.45	■■■■■ 4.55
OLFM1-208	ENST00000392991	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		43.44	■■■■■ 4.54
OLFM1-208	ENST00000392991	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	43.42	■■■■■ 4.54
OLFM1-208	ENST00000392991	PDE3B	Q13370	1112 aa		43.41	■■■■■ 4.54
OLFM1-208	ENST00000392991	DDB1	Q16531	1140 aa		43.39	■■■■■ 4.54
OLFM1-208	ENST00000392991	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		43.38	■■■■■ 4.53
OLFM1-208	ENST00000392991	NBPF4	Q96M43	638 aa		43.38	■■■■■ 4.53
OLFM1-208	ENST00000392991	IL2RB	P14784	551 aa		43.36	■■■■■ 4.53
OLFM1-208	ENST00000392991	TNS2	Q63HR2	1409 aa		43.34	■■■■■ 4.53
OLFM1-208	ENST00000392991	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		43.32	■■■■■ 4.53
OLFM1-208	ENST00000392991	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	43.3	■■■■■ 4.52
OLFM1-208	ENST00000392991	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		43.29	■■■■■ 4.52
OLFM1-208	ENST00000392991	CCDC125	Q86Z20	511 aa		43.29	■■■■■ 4.52
OLFM1-208	ENST00000392991	EXOC5	O00471	708 aa		43.28	■■■■■ 4.52
OLFM1-208	ENST00000392991	MEGF6	O75095	1541 aa		43.27	■■■■■ 4.52
OLFM1-208	ENST00000392991	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	43.27	■■■■■ 4.52
OLFM1-208	ENST00000392991	NCAPD2	Q15021	1401 aa		43.27	■■■■■ 4.52
OLFM1-208	ENST00000392991	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		43.26	■■■■■ 4.52
OLFM1-208	ENST00000392991	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	43.26	■■■■■ 4.52
OLFM1-208	ENST00000392991	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		43.22	■■■■■ 4.51
OLFM1-208	ENST00000392991	EYA1	Q99502	592 aa		43.21	■■■■■ 4.51
OLFM1-208	ENST00000392991	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	43.19	■■■■■ 4.51
OLFM1-208	ENST00000392991	MTHFS	P49914	203 aa		43.18	■■■■■ 4.5
OLFM1-208	ENST00000392991	BCL9	O00512	1426 aa		43.16	■■■■■ 4.5
OLFM1-208	ENST00000392991	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		43.15	■■■■■ 4.5
OLFM1-208	ENST00000392991	TRIM37	O94972	964 aa		43.15	■■■■■ 4.5
OLFM1-208	ENST00000392991	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		43.14	■■■■■ 4.5
OLFM1-208	ENST00000392991	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	43.13	■■■■■ 4.49
OLFM1-208	ENST00000392991	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	43.13	■■■■■ 4.49
OLFM1-208	ENST00000392991	SBF2	Q86WG5	1849 aa		43.11	■■■■■ 4.49
OLFM1-208	ENST00000392991	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		43.11	■■■■■ 4.49
OLFM1-208	ENST00000392991	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		43.1	■■■■■ 4.49
OLFM1-208	ENST00000392991	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	43.09	■■■■■ 4.49
OLFM1-208	ENST00000392991	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	43.09	■■■■■ 4.49
OLFM1-208	ENST00000392991	IL13	P35225	146 aa		43.08	■■■■■ 4.49

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