RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.79■■■□□ 2.2
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UBE2E3-201ENST00000392415 CRB1P82279 1406 aa28.78■■■□□ 2.2
UBE2E3-201ENST00000392415 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
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UBE2E3-201ENST00000392415 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.77■■■□□ 2.2
UBE2E3-201ENST00000392415 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.77■■■□□ 2.2
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCC6O95255 1503 aa28.75■■■□□ 2.19
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.73■■■□□ 2.19
UBE2E3-201ENST00000392415 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.71■■■□□ 2.19
UBE2E3-201ENST00000392415 LTN1O94822 1766 aa28.71■■■□□ 2.19
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM182BQ5T319 152 aa28.7■■■□□ 2.19
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UBE2E3-201ENST00000392415 MYOM1P52179 1685 aa28.68■■■□□ 2.18
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UBE2E3-201ENST00000392415 COG3Q96JB2 828 aa28.68■■■□□ 2.18
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UBE2E3-201ENST00000392415 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.65■■■□□ 2.18
UBE2E3-201ENST00000392415 FYB1O15117 783 aa28.64■■■□□ 2.17
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.64■■■□□ 2.17
UBE2E3-201ENST00000392415 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.64■■■□□ 2.17
UBE2E3-201ENST00000392415 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.62■■■□□ 2.17
UBE2E3-201ENST00000392415 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.62■■■□□ 2.17
UBE2E3-201ENST00000392415 ERBB3P21860 1342 aa28.61■■■□□ 2.17
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UBE2E3-201ENST00000392415 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.6■■■□□ 2.17
UBE2E3-201ENST00000392415 IP6K1Q92551 441 aa28.59■■■□□ 2.17
UBE2E3-201ENST00000392415 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.59■■■□□ 2.17
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC7Q96M83 1385 aa28.59■■■□□ 2.17
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UBE2E3-201ENST00000392415 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.58■■■□□ 2.17
UBE2E3-201ENST00000392415 BAG6P46379 1132 aa28.57■■■□□ 2.16
UBE2E3-201ENST00000392415 DDB1Q16531 1140 aa28.57■■■□□ 2.16
UBE2E3-201ENST00000392415 DISP2A7MBM2 1401 aa28.57■■■□□ 2.16
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UBE2E3-201ENST00000392415 FBLN1P23142 703 aa28.56■■■□□ 2.16
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.56■■■□□ 2.16
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UBE2E3-201ENST00000392415 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.55■■■□□ 2.16
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM37O94972 964 aa28.54■■■□□ 2.16
UBE2E3-201ENST00000392415 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
UBE2E3-201ENST00000392415 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.53■■■□□ 2.16
UBE2E3-201ENST00000392415 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.53■■■□□ 2.16
UBE2E3-201ENST00000392415 PEAK1Q9H792 1746 aa28.51■■■□□ 2.16
UBE2E3-201ENST00000392415 HOXC9P31274 260 aa28.51■■■□□ 2.15
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UBE2E3-201ENST00000392415 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
UBE2E3-201ENST00000392415 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.5■■■□□ 2.15
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UBE2E3-201ENST00000392415 APBA3O96018 575 aa28.44■■■□□ 2.14
UBE2E3-201ENST00000392415 IL2RBP14784 551 aa28.44■■■□□ 2.14
UBE2E3-201ENST00000392415 BCL9O00512 1426 aa28.44■■■□□ 2.14
UBE2E3-201ENST00000392415 TNS2Q63HR2 1409 aa28.44■■■□□ 2.14
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.43■■■□□ 2.14
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UBE2E3-201ENST00000392415 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
UBE2E3-201ENST00000392415 PANK3Q9H999 370 aa28.41■■■□□ 2.14
UBE2E3-201ENST00000392415 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.4■■■□□ 2.14
UBE2E3-201ENST00000392415 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.39■■■□□ 2.14
UBE2E3-201ENST00000392415 FLT4P35916 1363 aa28.38■■■□□ 2.13
UBE2E3-201ENST00000392415 INSRP06213 1382 aa28.37■■■□□ 2.13
UBE2E3-201ENST00000392415 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.37■■■□□ 2.13
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.36■■■□□ 2.13
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UBE2E3-201ENST00000392415 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
UBE2E3-201ENST00000392415 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.35■■■□□ 2.13
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UBE2E3-201ENST00000392415 NBPF4Q96M43 638 aa28.34■■■□□ 2.13
UBE2E3-201ENST00000392415 RREB1Q92766 1687 aa28.33■■■□□ 2.13
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.32■■■□□ 2.12
UBE2E3-201ENST00000392415 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.32■■■□□ 2.12
UBE2E3-201ENST00000392415 PLSCR1O15162 318 aa28.31■■■□□ 2.12
UBE2E3-201ENST00000392415 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
UBE2E3-201ENST00000392415 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.3■■■□□ 2.12
UBE2E3-201ENST00000392415 NSD2O96028 1365 aa28.29■■■□□ 2.12
UBE2E3-201ENST00000392415 POLKQ9UBT6 870 aa28.29■■■□□ 2.12
UBE2E3-201ENST00000392415 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.28■■■□□ 2.12
UBE2E3-201ENST00000392415 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
UBE2E3-201ENST00000392415 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.26■■■□□ 2.12
UBE2E3-201ENST00000392415 MEGF6O75095 1541 aa28.26■■■□□ 2.11
UBE2E3-201ENST00000392415 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.26■■■□□ 2.11
UBE2E3-201ENST00000392415 NHSQ6T4R5 1651 aa28.26■■■□□ 2.11
UBE2E3-201ENST00000392415 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.26■■■□□ 2.11
UBE2E3-201ENST00000392415 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
UBE2E3-201ENST00000392415 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.25■■■□□ 2.11
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNQ2O43526 872 aa28.24■■■□□ 2.11
UBE2E3-201ENST00000392415 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
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