RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 KIF24Q5T7B8 1368 aa39.86■■■■□ 3.97
ECHS1-201ENST00000368547 RTL1A6NKG5 1358 aa39.86■■■■□ 3.97
ECHS1-201ENST00000368547 FLT4P35916 1363 aa39.86■■■■□ 3.97
ECHS1-201ENST00000368547 HOXC9P31274 260 aa39.84■■■■□ 3.97
ECHS1-201ENST00000368547 LMO7Q8WWI1 1683 aa39.84■■■■□ 3.97
ECHS1-201ENST00000368547 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
ECHS1-201ENST00000368547 IP6K1Q92551 441 aa39.83■■■■□ 3.97
ECHS1-201ENST00000368547 ABCC6O95255 1503 aa39.83■■■■□ 3.97
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ECHS1-201ENST00000368547 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
ECHS1-201ENST00000368547 AXIN2Q9Y2T1 843 aa39.81■■■■□ 3.96
ECHS1-201ENST00000368547 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa39.8■■■■□ 3.96
ECHS1-201ENST00000368547 C8orf37Q96NL8 207 aa39.79■■■■□ 3.96
ECHS1-201ENST00000368547 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa39.78■■■■□ 3.96
ECHS1-201ENST00000368547 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
ECHS1-201ENST00000368547 INSRP06213 1382 aa39.76■■■■□ 3.96
ECHS1-201ENST00000368547 CFAP53Q96M91 514 aa39.75■■■■□ 3.95
ECHS1-201ENST00000368547 NGLY1Q96IV0 654 aa39.74■■■■□ 3.95
ECHS1-201ENST00000368547 BTG4Q9NY30 223 aa39.74■■■■□ 3.95
ECHS1-201ENST00000368547 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
ECHS1-201ENST00000368547 NWD2Q9ULI1 1742 aa39.72■■■■□ 3.95
ECHS1-201ENST00000368547 SLIT2O94813 1529 aa39.71■■■■□ 3.95
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC184Q52MB2 194 aa39.7■■■■□ 3.95
ECHS1-201ENST00000368547 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
ECHS1-201ENST00000368547 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
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ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD24Q8TF21 1146 aa39.68■■■■□ 3.94
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ECHS1-201ENST00000368547 IL13P35225 146 aa39.62■■■■□ 3.93
ECHS1-201ENST00000368547 BCL9LQ86UU0 1499 aa39.61■■■■□ 3.93
ECHS1-201ENST00000368547 AFF2P51816 1311 aa39.61■■■■□ 3.93
ECHS1-201ENST00000368547 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa39.61■■■■□ 3.93
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ECHS1-201ENST00000368547 USP21Q9UK80 565 aa39.58■■■■□ 3.93
ECHS1-201ENST00000368547 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
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ECHS1-201ENST00000368547 NUDCQ9Y266 331 aa39.54■■■■□ 3.92
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ECHS1-201ENST00000368547 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa39.53■■■■□ 3.92
ECHS1-201ENST00000368547 NLRP2Q9NX02 1062 aa39.53■■■■□ 3.92
ECHS1-201ENST00000368547 NBPF6Q5VWK0 638 aa39.52■■■■□ 3.92
ECHS1-201ENST00000368547 NBPF4Q96M43 638 aa39.52■■■■□ 3.92
ECHS1-201ENST00000368547 EYA1Q99502 592 aa39.52■■■■□ 3.92
ECHS1-201ENST00000368547 CRB1P82279 1406 aa39.51■■■■□ 3.92
ECHS1-201ENST00000368547 IGSF1Q8N6C5 1336 aa39.48■■■■□ 3.91
ECHS1-201ENST00000368547 USHBP1Q8N6Y0 703 aa39.47■■■■□ 3.91
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ECHS1-201ENST00000368547 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
ECHS1-201ENST00000368547 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP39.45■■■■□ 3.91
ECHS1-201ENST00000368547 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP39.45■■■■□ 3.91
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ECHS1-201ENST00000368547 CARD10Q9BWT7 1032 aa39.45■■■■□ 3.91
ECHS1-201ENST00000368547 USP35Q9P2H5 1018 aa39.44■■■■□ 3.9
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
ECHS1-201ENST00000368547 NCAPD2Q15021 1401 aa39.41■■■■□ 3.9
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa39.41■■■■□ 3.9
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa39.41■■■■□ 3.9
ECHS1-201ENST00000368547 HMOX1P09601 288 aa39.41■■■■□ 3.9
ECHS1-201ENST00000368547 SULT6B1Q6IMI4 303 aa39.41■■■■□ 3.9
ECHS1-201ENST00000368547 ATRNO75882 1429 aa39.4■■■■□ 3.9
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa39.4■■■■□ 3.9
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
ECHS1-201ENST00000368547 AEBP1Q8IUX7 1158 aa39.4■■■■□ 3.9
ECHS1-201ENST00000368547 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
ECHS1-201ENST00000368547 ADAMTS8Q9UP79 889 aa39.38■■■■□ 3.89
ECHS1-201ENST00000368547 KDRP35968 1356 aa39.38■■■■□ 3.89
ECHS1-201ENST00000368547 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
ECHS1-201ENST00000368547 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
ECHS1-201ENST00000368547 FAM9BQ8IZU0 186 aa39.36■■■■□ 3.89
ECHS1-201ENST00000368547 TCP11L2Q8N4U5 519 aa39.34■■■■□ 3.89
ECHS1-201ENST00000368547 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
ECHS1-201ENST00000368547 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
ECHS1-201ENST00000368547 RSPH6AQ9H0K4 717 aa39.32■■■■□ 3.89
ECHS1-201ENST00000368547 WNK3Q9BYP7 1800 aa39.32■■■■□ 3.89
ECHS1-201ENST00000368547 GLI3P10071 1580 aa39.32■■■■□ 3.88
ECHS1-201ENST00000368547 FCHSD2O94868 740 aa39.31■■■■□ 3.88
ECHS1-201ENST00000368547 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
ECHS1-201ENST00000368547 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
ECHS1-201ENST00000368547 PRKAR2BP31323 418 aa39.28■■■■□ 3.88
ECHS1-201ENST00000368547 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa39.28■■■■□ 3.88
ECHS1-201ENST00000368547 MEGF6O75095 1541 aa39.27■■■■□ 3.88
ECHS1-201ENST00000368547 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
ECHS1-201ENST00000368547 IL2RBP14784 551 aa39.25■■■■□ 3.87
ECHS1-201ENST00000368547 BARGINQ6ZT62 677 aa39.25■■■■□ 3.87
ECHS1-201ENST00000368547 DISP2A7MBM2 1401 aa39.24■■■■□ 3.87
ECHS1-201ENST00000368547 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
ECHS1-201ENST00000368547 TATP17735 454 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC146Q8IYE0 955 aa39.22■■■■□ 3.87
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ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHF1Q96S99 279 aa39.22■■■■□ 3.87
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