RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
LRRC25-201ENST00000339007 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.77■■□□□ 1.24
LRRC25-201ENST00000339007 PRKAR2BP31323 418 aa22.77■■□□□ 1.24
LRRC25-201ENST00000339007 VAMP4O75379 141 aa22.76■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.76■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.75■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.74■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 ABCC4O15439 1325 aa22.74■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 PTPRMP28827 1452 aa22.74■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 NFE2L2Q16236 605 aa22.72■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 CFAP44Q96MT7 982 aa22.72■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.72■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 TPM2P07951 284 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 GNAI1P63096 354 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 RABEP1Q15276 862 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 PRAM1Q96QH2 718 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 TSPYL6Q8N831 410 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 IFT57Q9NWB7 429 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRC25-201ENST00000339007 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.7■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.69■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 IDI1Q13907 227 aa22.69■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.69■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 NUCB2P80303 420 aa22.68■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.67■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 POLKQ9UBT6 870 aa22.67■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 MBIPQ9NS73 344 aa22.67■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 CABP1Q9NZU7 370 aa22.66■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 HMOX1P09601 288 aa22.66■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF853P0CG23 659 aa22.66■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF445P59923 1031 aa22.66■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 CDK19Q9BWU1 502 aa22.65■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.65■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 AK9Q5TCS8 1911 aa22.65■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 MCTP1Q6DN14 999 aa22.65■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.64■■□□□ 1.22
LRRC25-201ENST00000339007 TTC22Q5TAA0 569 aa22.64■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 DCTPP1Q9H773 170 aa22.63■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.62■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.62■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.62■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 USP26Q9BXU7 913 aa22.62■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 FBLN1P23142 703 aa22.61■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.6■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.6■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.6■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.6■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.6■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.6■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 OFD1O75665 1012 aa22.6■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.6■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 HS1BP3Q53T59 392 aa22.59■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
LRRC25-201ENST00000339007 ST18O60284 1047 aa22.58■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 CASC1Q6TDU7 716 aa22.58■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 ATP7BP35670 1465 aa22.57■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.57■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 IL13P35225 146 aa22.57■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 PKP1Q13835 747 aa22.56■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.55■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.55■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.55■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.55■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 TERF1P54274 439 aa22.55■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.54■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 SDSP20132 328 aa22.53■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 ZMYND15Q9H091 742 aa22.53■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 RBSNQ9H1K0 784 aa22.53■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 ATP10DQ9P241 1426 aa22.53■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.53■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.53■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.53■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 ALKQ9UM73 1620 aa22.53■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.1 ms