RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 PTCH1Q13635 1447 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-202ENST00000323081 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-202ENST00000323081 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-202ENST00000323081 USP6P35125 1406 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-202ENST00000323081 TRIM27P14373 513 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-202ENST00000323081 DIP2AQ14689 1571 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-202ENST00000323081 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.52■■□□□ 1.19
SPNS1-202ENST00000323081 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.52■■□□□ 1.19
SPNS1-202ENST00000323081 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-202ENST00000323081 NFE2L2Q16236 605 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-202ENST00000323081 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-202ENST00000323081 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-202ENST00000323081 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-202ENST00000323081 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-202ENST00000323081 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-202ENST00000323081 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-202ENST00000323081 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-202ENST00000323081 SSH2Q76I76 1423 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-202ENST00000323081 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-202ENST00000323081 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-202ENST00000323081 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-202ENST00000323081 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-202ENST00000323081 PEAK1Q9H792 1746 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 KIF16BQ96L93 1317 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 USP31Q70CQ4 1352 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 USP35Q9P2H5 1018 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 SLC4A3P48751 1232 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF428Q96B54 188 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 KCNA6P17658 529 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 GNAI1P63096 354 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 IFT57Q9NWB7 429 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF853P0CG23 659 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-202ENST00000323081 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 VAMP4O75379 141 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 FAM83GA6ND36 823 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 SEC24BO95487 1268 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 MBIPQ9NS73 344 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 PIK3R4Q99570 1358 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 PIK3C2AO00443 1686 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 TSPYL6Q8N831 410 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 SOX12O15370 315 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 USP19O94966 1318 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 CFAP44Q96MT7 982 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 DCTN1Q14203 1278 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-202ENST00000323081 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-202ENST00000323081 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-202ENST00000323081 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-202ENST00000323081 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-202ENST00000323081 SMC5Q8IY18 1101 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-202ENST00000323081 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-202ENST00000323081 SBNO1A3KN83 1393 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-202ENST00000323081 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-202ENST00000323081 FLT4P35916 1363 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS1-202ENST00000323081 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-202ENST00000323081 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
SPNS1-202ENST00000323081 ARHGEF10O15013 1369 aa22.27■■□□□ 1.15
SPNS1-202ENST00000323081 USP54Q70EL1 1684 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-202ENST00000323081 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-202ENST00000323081 NLRP6P59044 892 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-202ENST00000323081 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-202ENST00000323081 KDRP35968 1356 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-202ENST00000323081 MCM10Q7L590 875 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-202ENST00000323081 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-202ENST00000323081 ABCC4O15439 1325 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-202ENST00000323081 AMPHP49418 695 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-202ENST00000323081 NUCB1Q02818 461 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-202ENST00000323081 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-202ENST00000323081 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-202ENST00000323081 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-202ENST00000323081 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-202ENST00000323081 CHL1O00533 1208 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 EYA1Q99502 592 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 FOXO3O43524 673 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms