RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293778.10

CXCL16-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 16, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL16, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16-201ENST00000293778 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
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CXCL16-201ENST00000293778 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.52■■□□□ 1.68
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CXCL16-201ENST00000293778 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.51■■□□□ 1.67
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CXCL16-201ENST00000293778 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.49■■□□□ 1.67
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CXCL16-201ENST00000293778 ZNF428Q96B54 188 aa25.49■■□□□ 1.67
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CXCL16-201ENST00000293778 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.39■■□□□ 1.66
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CXCL16-201ENST00000293778 PIK3R4Q99570 1358 aa25.31■■□□□ 1.64
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CXCL16-201ENST00000293778 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.3■■□□□ 1.64
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CXCL16-201ENST00000293778 FLT4P35916 1363 aa25.28■■□□□ 1.64
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CXCL16-201ENST00000293778 KRT24Q2M2I5 525 aa25.17■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.17■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.17■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 EYA1Q99502 592 aa25.17■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.16■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 GCC1Q96CN9 775 aa25.16■■□□□ 1.62
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CXCL16-201ENST00000293778 FOXO3O43524 673 aa25.15■■□□□ 1.62
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