RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 FBXW7Q969H0 707 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 BCL2L13Q9BXK5 485 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ERC2O15083 957 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 SDF4Q9BRK5 362 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 C10orf67Q8IYJ2 551 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 SMARCE1Q969G3 411 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 CRACR2AQ9BSW2 395 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 PANK2Q9BZ23 570 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 TMCO5BA8MYB1 307 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 SYNJ1O43426 1573 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 CLSTN1O94985 981 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ANO2Q9NQ90 1003 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRO-201ENST00000281171 LNPKQ9C0E8 428 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 GAS2L2Q8NHY3 880 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 GPRASP1Q5JY77 1395 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 SETSIPP0DME0 302 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 KINO60870 393 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 ATF3P18847 181 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 ARAP1Q96P48 1450 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 LUZP1Q86V48 1076 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 IGSF3O75054 1194 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 MAP9Q49MG5 647 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 TNMDQ9H2S6 317 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 LIG1P18858 919 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 FIBPO43427 364 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 IQCEQ6IPM2 695 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 POGZQ7Z3K3 1410 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 NEMFO60524 1076 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 GBP6Q6ZN66 633 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 TIAM1Q13009 1591 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 DAPK1P53355 1430 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 POTEB2H3BUK9 544 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 MCM3P25205 808 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 UVSSAQ2YD98 709 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 MAP3K1Q13233 1512 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 TRIM29Q14134 588 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 PDCP20941 246 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 DMTNQ08495 405 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 CBFA2T2O43439 604 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 MARCH6O60337 910 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 RSPH14Q9UHP6 348 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 GNAI3P08754 354 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 CUL7Q14999 1698 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 PDE3AQ14432 1141 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 TRDNQ13061 729 aa16.89■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC27Q2M243 656 aa16.89■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.3
PTPRO-201ENST00000281171 NEK4P51957 841 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRO-201ENST00000281171 KLHL40Q2TBA0 621 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRO-201ENST00000281171 PANK1Q8TE04 598 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRO-201ENST00000281171 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1B0GUA9 196 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRO-201ENST00000281171 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
PTPRO-201ENST00000281171 GOLIM4O00461 696 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRO-201ENST00000281171 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
PTPRO-201ENST00000281171 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRO-201ENST00000281171 ERLIN2O94905 339 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRO-201ENST00000281171 NUTM2FA1L443 756 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRO-201ENST00000281171 ODF2Q5BJF6 829 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRO-201ENST00000281171 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRO-201ENST00000281171 ZSCAN12O43309 604 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRO-201ENST00000281171 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
PTPRO-201ENST00000281171 TBC1D2Q9BYX2 928 aa16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms