RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CPDO75976 1380 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PEAK1Q9H792 1746 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HOXC9P31274 260 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LTN1O94822 1766 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IP6K1Q92551 441 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INSRP06213 1382 aa27.2■■□□□ 1.95
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 C8orf37Q96NL8 207 aa27.2■■□□□ 1.94
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 RTL1A6NKG5 1358 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BTG4Q9NY30 223 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL18A1P39060 1754 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NGLY1Q96IV0 654 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.14■■□□□ 1.94
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.13■■□□□ 1.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CFAP53Q96M91 514 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STRN4Q9NRL3 753 aa27.11■■□□□ 1.93
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 RGPD5Q99666 1765 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERBB3P21860 1342 aa27.09■■□□□ 1.93
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 IL13P35225 146 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.08■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLIT2O94813 1529 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EVA1CP58658 441 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCC6O95255 1503 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.06■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AFF2P51816 1311 aa27.06■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP21Q9UK80 565 aa27.04■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.04■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NBPF4Q96M43 638 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EYA1Q99502 592 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.02■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.02■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.01■■□□□ 1.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP35Q9P2H5 1018 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NUDCQ9Y266 331 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NRAPQ86VF7 1730 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HMOX1P09601 288 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.95■■□□□ 1.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.95■■□□□ 1.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRB1P82279 1406 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VPS72Q15906 364 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATRNO75882 1429 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.86■■□□□ 1.89
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NCAPD2Q15021 1401 aa26.86■■□□□ 1.89
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRKAR2BP31323 418 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FCHSD2O94868 740 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MEGF6O75095 1541 aa26.82■■□□□ 1.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDE3BQ13370 1112 aa26.82■■□□□ 1.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.82■■□□□ 1.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.82■■□□□ 1.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POTEAQ6S8J7 498 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IL2RBP14784 551 aa26.8■■□□□ 1.88
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