RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440184.1

CBX1P1-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P1, Length 427 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P1-201ENST00000440184 POSTNQ15063 836 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 PDGFRLQ15198 375 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 ELF2Q15723 593 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 ADRM1Q16186 407 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 CFAP221Q4G0U5 840 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 MDH1BQ5I0G3 518 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 ZNF585AQ6P3V2 769 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 MON1AQ86VX9 555 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 ADGRF2Q8IZF7 708 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 CMTM4Q8IZR5 234 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 LRRC52Q8N7C0 313 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 PDILTQ8N807 584 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 OR5B17Q8NGF7 314 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 CD101Q93033 1021 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 MYLPFQ96A32 169 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 ACCSQ96QU6 501 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 ACOX2Q99424 681 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 ACBD6Q9BR61 282 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 KLC2Q9H0B6 622 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 DPEP3Q9H4B8 488 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 ECT2Q9H8V3 914 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 OLFML3Q9NRN5 406 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 GCNT4Q9P109 453 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 CFAP97Q9P2B7 532 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 SEL1LQ9UBV2 794 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 SIX4Q9UIU6 781 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 ITGA11Q9UKX5 1188 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 EXOC7Q9UPT5 735 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 RAD54BQ9Y620 910 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 KNL1Q8NG31 2342 aa4.74□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 K7EQS6 105 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 LEFTY2O00292 366 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 MDM4O15151 490 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 PCDHGA12O60330 932 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 HUS1O60921 280 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 ATG13O75143 517 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 AKAP3O75969 853 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 STC2O76061 302 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 APBB3O95704 486 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 LDHAP00338 332 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 PRB1P04280 392 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 PROS1P07225 676 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 RBP3P10745 1247 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 OSMP13725 252 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 MTHFD2P13995 350 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 GAP43P17677 238 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 ENGP17813 658 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 DRD1P21728 446 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 CASP4P49662 377 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 WNT3AP56704 352 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 MYL7Q01449 175 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 PPP3CAQ08209 521 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 CUL4AQ13619 759 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 KCNB1Q14721 858 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 FBXO43Q4G163 708 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 RRAGBQ5VZM2 374 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 PMS2CLQ68D20 193 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 FAM171BQ6P995 826 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 LAYNQ6UX15 382 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 CBWD2Q8IUF1 395 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 NELFCDQ8IXH7 590 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 TMEM86AQ8N2M4 240 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 GPD1LQ8N335 351 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 CPA6Q8N4T0 437 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 MDM1Q8TC05 714 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 SPATA18Q8TC71 538 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 SNX33Q8WV41 574 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 OSCP1Q8WVF1 389 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 USP28Q96RU2 1077 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 FNBP1Q96RU3 617 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 SYT15Q9BQS2 421 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 TMEM206Q9H813 350 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 TMEM9BQ9NQ34 198 aa4.73□□□□□ -1.65
CBX1P1-201ENST00000440184 VPS45Q9NRW7 570 aa4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms