RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 THAP1Q9NVV9 213 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 HYPKQ9NX55 129 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 KLQ9UEF7 1012 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 SLC13A4Q9UKG4 626 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 DTX4Q9Y2E6 619 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 CPS1P31327 1500 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 TTC41PQ6P2S7 1318 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 WDR17Q8IZU2 1322 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 SLC22A23A1A5C7 686 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 CTAGE5O15320 804 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 KLK10O43240 276 aa5.4□□□□□ -1.54
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TRDN-204ENST00000542443 USP12O75317 370 aa5.4□□□□□ -1.54
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TRDN-204ENST00000542443 BMP15O95972 392 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
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TRDN-204ENST00000542443 HSF1Q00613 529 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 MTX1Q13505 466 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 TRPC3Q13507 836 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 MORN5Q5VZ52 161 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ATL3Q6DD88 541 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ANO7Q6IWH7 933 aa5.4□□□□□ -1.54
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TRDN-204ENST00000542443 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 FAM47BQ8NA70 645 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 BCAS4Q8TDM0 211 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ZBTB9Q96C00 473 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
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TRDN-204ENST00000542443 TRIM31Q9BZY9 425 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 IL25Q9H293 177 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ZNF446Q9NWS9 450 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 CD207Q9UJ71 328 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 SMC3Q9UQE7 1217 aa5.4□□□□□ -1.54
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TRDN-204ENST00000542443 GDAQ9Y2T3 454 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 V9GYY5 206 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 PEAK1Q9H792 1746 aa5.4□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 MRC1P22897 1456 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 ABCC6O95255 1503 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 METTL18O95568 372 aa5.39□□□□□ -1.55
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TRDN-204ENST00000542443 RPS6KA3P51812 740 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 CFHR1Q03591 330 aa5.39□□□□□ -1.55
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TRDN-204ENST00000542443 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 LIPMQ5VYY2 423 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 CTR9Q6PD62 1173 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 SLC2A7Q6PXP3 512 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.39□□□□□ -1.55
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TRDN-204ENST00000542443 UNC5CLQ8IV45 518 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 VPS52Q8N1B4 723 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 ESX1Q8N693 406 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 DENND1AQ8TEH3 1009 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 HTRA1Q92743 480 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 KAT2BQ92831 832 aa5.39□□□□□ -1.55
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TRDN-204ENST00000542443 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 RICTORQ6R327 1708 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 FMN2Q9NZ56 1722 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 SBNO1A3KN83 1393 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 RFX7Q2KHR2 1363 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 PTPRUQ92729 1446 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 A2ML1A8K2U0 1454 aa5.39□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 C2CD4BA6NLJ0 364 aa5.38□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 KCNJ18B7U540 433 aa5.38□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 IGKV2-30P06310 120 aa5.38□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 CYP4B1P13584 511 aa5.38□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 GJB2P29033 226 aa5.38□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 KCNJ4P48050 445 aa5.38□□□□□ -1.55
TRDN-204ENST00000542443 MMP14P50281 582 aa5.38□□□□□ -1.55
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