RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa27.14■■□□□ 1.93
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ODC1-204ENST00000446285 POP4O95707 220 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
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ODC1-204ENST00000446285 IQCB1Q15051 598 aa27.13■■□□□ 1.93
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ODC1-204ENST00000446285 FNIP1Q8TF40 1166 aa27.13■■□□□ 1.93
ODC1-204ENST00000446285 ARHGEF26Q96DR7 871 aa27.13■■□□□ 1.93
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ODC1-204ENST00000446285 FADS3Q9Y5Q0 445 aa27.13■■□□□ 1.93
ODC1-204ENST00000446285 ACTL7AQ9Y615 435 aa27.13■■□□□ 1.93
ODC1-204ENST00000446285 GOLGA8CPA6NN73 597 aa27.12■■□□□ 1.93
ODC1-204ENST00000446285 BUB1O43683 1085 aa27.12■■□□□ 1.93
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ODC1-204ENST00000446285 THEGLP0DJG4 465 aa27.12■■□□□ 1.93
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ODC1-204ENST00000446285 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
ODC1-204ENST00000446285 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa27.12■■□□□ 1.93
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ODC1-204ENST00000446285 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
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ODC1-204ENST00000446285 TSPAN6O43657 245 aa27.11■■□□□ 1.93
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ODC1-204ENST00000446285 SLC17A9Q9BYT1 436 aa27.11■■□□□ 1.93
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ODC1-204ENST00000446285 C16orf96A6NNT2 1141 aa27.09■■□□□ 1.93
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ODC1-204ENST00000446285 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
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ODC1-204ENST00000446285 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
ODC1-204ENST00000446285 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa27.07■■□□□ 1.92
ODC1-204ENST00000446285 FREM2Q5SZK8 3169 aa27.07■■□□□ 1.92
ODC1-204ENST00000446285 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.922e-20■■■■■ 56
ODC1-204ENST00000446285 NEMP1O14524 444 aa27.07■■□□□ 1.92
ODC1-204ENST00000446285 RFPL3O75679 317 aa27.07■■□□□ 1.92
ODC1-204ENST00000446285 RHOAP61586 193 aa27.07■■□□□ 1.92
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