RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ATP2A3Q93084 1043 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 UBXN6Q9BZV1 441 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 TRIM2Q9C040 744 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 RMI1Q9H9A7 625 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 NOD2Q9HC29 1040 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 MTMR4Q9NYA4 1195 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 GGA3Q9NZ52 723 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 PDP2Q9P2J9 529 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 TTC21AQ8NDW8 1320 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 TSPOAP1O95153 1857 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ALKQ9UM73 1620 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 MSH6P52701 1360 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 SAC3D1A6NKF1 404 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 LATS1O95835 1130 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 PYGLP06737 847 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 CSF1P09603 554 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 CCDC192P0DO97 292 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 PAX3P23760 479 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 SOX2P48431 317 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 CDK18Q07002 472 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 SLC12A1Q13621 1099 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD1Q15327 319 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 BBS12Q6ZW61 710 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 KRT222Q8N1A0 295 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 USP38Q8NB14 1042 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 IL17REQ8NFR9 667 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 LINS1Q8NG48 757 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 FCRL5Q96RD9 977 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 SH2D3AQ9BRG2 576 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 TM2D2Q9BX73 214 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 MLXIPLQ9NP71 852 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 TMEM160Q9NX00 188 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 MTMR6Q9Y217 621 aa5.45□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 JCADQ9P266 1359 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 TECPR2O15040 1411 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 STX6O43752 255 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 POLBP06746 335 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 TGM2P21980 687 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 PRPH2P23942 346 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 CNTFP26441 200 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 EPHB2P29323 1055 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 TACR3P29371 465 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 CCT4P50991 539 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 CCR5P51681 352 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 B4GALNT1Q00973 533 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 TLE2Q04725 743 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 UBE3AQ05086 875 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 POU5F1BQ06416 359 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 CHRNDQ07001 517 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ETFDHQ16134 617 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 RTL10Q7L3V2 364 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ERO1AQ96HE7 468 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 C5orf34Q96MH7 638 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 TIGD1Q96MW7 591 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 REEP2Q9BRK0 252 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ERVK-5Q9HDB9 667 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 BABAM1Q9NWV8 329 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 EMSYQ7Z589 1322 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 MYO5BQ9ULV0 1848 aa5.44□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 USP54Q70EL1 1684 aa5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 MAP3K5Q99683 1374 aa5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GVC2 190 aa5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 VWA3AA6NCI4 1184 aa5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 TP73O15350 636 aa5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 RNF8O76064 485 aa5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 AKR1A1P14550 325 aa5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 SYT1P21579 422 aa5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ZNF75DP51815 510 aa5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ADPRHP54922 357 aa5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms