RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409915.8

SF3B1-202, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SF3B1, Length 600 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1-202ENST00000409915 LRRC14BA6NHZ5 514 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 USP27XA6NNY8 438 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 K7ERI5 159 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 UBE2CO00762 179 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 GNB5O14775 395 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 N4BP3O15049 544 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ASNA1O43681 348 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 LPXNO60711 386 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ADAM23O75077 832 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 TSPAN9O75954 239 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 BEST1O76090 585 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 RECQL4O94761 1208 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 NDST3O95803 873 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 POMCP01189 267 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 MMEP08473 750 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 CSF1P09603 554 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 LINGO3P0C6S8 592 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 CSH1P0DML2 217 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 CSH2P0DML3 217 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 SRGAP2BP0DMP2 458 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 NR2F1P10589 423 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 FOSL2P15408 326 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 PAMP19021 973 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 CMA1P23946 247 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ACSL1P33121 698 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ARL3P36405 182 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 DPP6P42658 865 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 SCNN1GP51170 649 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 NDUFA8P51970 172 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 EFNA5P52803 228 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 NCKAP1LP55160 1127 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 LGALS4P56470 323 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 OSTNP61366 133 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 FAM189BP81408 668 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 RBP5P82980 135 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 IL1RL1Q01638 556 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ID3Q02535 119 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 COASYQ13057 564 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 XRCC4Q13426 336 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 NAA25Q14CX7 972 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 GPR19Q15760 415 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 FAM187BQ17R55 369 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ZNF568Q3ZCX4 644 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 CCDC40Q4G0X9 1142 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 VWA3BQ502W6 1294 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 EPC2Q52LR7 807 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 C3orf38Q5JPI3 329 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 GLRA4Q5JXX5 417 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ATF7IP2Q5U623 682 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 CPZQ66K79 652 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ADALQ6DHV7 355 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 SLC27A1Q6PCB7 646 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 TRIM65Q6PJ69 517 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 C6orf89Q6UWU4 347 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 LRRC55Q6ZSA7 311 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 NUP54Q7Z3B4 507 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 TMC6Q7Z403 805 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 SZRD1Q7Z422 152 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 HAUS6Q7Z4H7 955 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 THAP5Q7Z6K1 395 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 TTC7BQ86TV6 843 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ZNF280BQ86YH2 543 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ABI1Q8IZP0 508 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 TRPC4APQ8TEL6 797 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 IRGQQ8WZA9 623 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 P3H4Q92791 437 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 FEM1CQ96JP0 617 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 NOX5Q96PH1 765 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 GAD1Q99259 594 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 SH3GL2Q99962 352 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 HGH1Q9BTY7 390 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 TIPINQ9BVW5 301 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 TRIM9Q9C026 710 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 HAPLN2Q9GZV7 340 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 TMEM117Q9H0C3 514 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 CDT1Q9H211 546 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 PRDM13Q9H4Q3 707 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 PARVGQ9HBI0 331 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 PDE11AQ9HCR9 933 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 SERHLQ9NQF3 203 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 SACM1LQ9NTJ5 587 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 TBC1D13Q9NVG8 400 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 KCND2Q9NZV8 630 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 ATXN10Q9UBB4 475 aa4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SF3B1-202ENST00000409915 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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