RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510921.5

CCNH-208, Transcript of cyclin H, human

TSL 4

Gene CCNH, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNH-208	ENST00000510921	EXD3	Q8N9H8	876 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	ASB5	Q8WWX0	329 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	HERVK_113	Q902F9	699 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	KCNJ9	Q92806	393 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	ZNF347	Q96SE7	839 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	RMI1	Q9H9A7	625 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	TSPAN3	O60637	253 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	METTL18	O95568	372 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	CKMT1A	P12532	417 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	MT3	P25713	68 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	STAT1	P42224	750 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921		Q6ZTC4	211 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	GALNT7	Q86SF2	657 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	KLB	Q86Z14	1044 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	CPO	Q8IVL8	374 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	TMEM199	Q8N511	208 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	LINS1	Q8NG48	757 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	ARL15	Q9NXU5	204 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	GJD2	Q9UKL4	321 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	SUFU	Q9UMX1	484 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	GDA	Q9Y2T3	454 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	SYN3	O14994	580 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	LYL1	P12980	280 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	CYP4B1	P13584	511 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	GSTM2	P28161	218 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	TNFRSF8	P28908	595 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	RPS6KA3	P51812	740 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	RHAG	Q02094	409 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	TLE2	Q04725	743 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	PPAT	Q06203	517 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	HYAL1	Q12794	435 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	GALNT3	Q14435	633 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	PGM5	Q15124	567 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	ISM2	Q6H9L7	571 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	BBS12	Q6ZW61	710 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	VPS52	Q8N1B4	723 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	REEP2	Q9BRK0	252 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	THAP1	Q9NVV9	213 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	KL	Q9UEF7	1012 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	ICK	Q9UPZ9	632 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	DPPA5	A6NC42	116 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	TMEM247	A6NEH6	219 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	CXorf65	A6NEN9	183 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	KCNJ18	B7U540	433 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	KLK10	O43240	276 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	ANP32C	O43423	234 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	KRT86	O43790	486 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	NFATC1	O95644	943 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	IFNA2	P01563	188 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	WNT1	P04628	370 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	PLA2G2A	P14555	144 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	CPA1	P15085	419 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	CNTF	P26441	200 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	TYK2	P29597	1187 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	CCR5	P51681	352 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	VAMP2	P63027	116 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	CHRND	Q07001	517 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	KRT81	Q14533	505 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	ASIC2	Q16515	512 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	ALF	Q53S48	1182 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CCNH-208	ENST00000510921	ATG16L1	Q676U5	607 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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