RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 PTMSP20962 102 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 GRIA4P48058 902 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 CLCN6P51797 869 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 POM121L1PQ3SYA9 428 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM72AQ5TYM5 149 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM72DQ6L9T8 149 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 RETSATQ6NUM9 610 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 SCYL2Q6P3W7 929 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 DCUN1D2Q6PH85 259 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 IL27RAQ6UWB1 636 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 SLFN11Q7Z7L1 901 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM72BQ86X60 149 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 NTAN1Q96AB6 310 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D31Q96DN5 1066 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 VCPIP1Q96JH7 1222 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC114Q96M63 670 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 HAUS4Q9H6D7 363 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 IL21RQ9HBE5 538 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 AIPL1Q9NZN9 384 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D3EA0A087X179 549 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D3LB9A6J9 549 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 RTN2O75298 545 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 LRIG2O94898 1065 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D3HP0C7X1 549 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 RHOQP17081 205 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 MAPKAPK2P49137 400 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 CCR5P51681 352 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 FANCCQ00597 558 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 HLA-BQ31612 363 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 C22orf39Q6P5X5 142 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 LAYNQ6UX15 382 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 NLRP14Q86W24 1093 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 OR2A12Q8NGT7 310 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 CNPY3Q9BT09 278 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 EDEM3Q9BZQ6 932 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TTYH3Q9C0H2 523 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 RETREG1Q9H6L5 497 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 EBF2Q9HAK2 575 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 NDFIP2Q9NV92 336 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM248Q9NWD8 314 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 DNAI1Q9UI46 699 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC7A4O43246 635 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 SH3BP5O60239 455 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 ZMPSTE24O75844 475 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 CTSLP07711 333 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 DESP17661 470 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 CHRNA3P32297 505 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 ETFBP38117 255 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 PRKCIP41743 596 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 RACK1P63244 317 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC20A2Q08357 652 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 KLHL30Q0D2K2 578 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 SCAPQ12770 1279 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 CNTN1Q12860 1018 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF19Q2TAC6 998 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 EFHC2Q5JST6 749 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 PYROXD2Q8N2H3 581 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM131CQ96AQ9 280 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC6A18Q96N87 628 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TNKS2Q9H2K2 1166 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TM7SF3Q9NS93 570 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 NEU3Q9UQ49 428 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 SNX11Q9Y5W9 270 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 C10orf142B7Z368 130 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF883P0CG24 379 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 L1CAMP32004 1257 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 ACVRL1P37023 503 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 UBASH3AP57075 661 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP2CBP62714 309 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP2CAP67775 309 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 ARF5P84085 180 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 OGDHQ02218 1023 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 MAMLD1Q13495 774 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 FIGNQ5HY92 759 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 AGBL4Q5VU57 503 aa17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms