RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
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ACTB-206ENST00000443528 ERCC2P18074 760 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 OXTRP30559 389 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ACSL1P33121 698 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 MPLP40238 635 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 METAP1P53582 386 aa16.05■□□□□ 0.16
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ACTB-206ENST00000443528 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.05■□□□□ 0.16
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ACTB-206ENST00000443528 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
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ACTB-206ENST00000443528 CFAP54Q96N23 3096 aa16.05■□□□□ 0.16
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ACTB-206ENST00000443528 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
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ACTB-206ENST00000443528 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
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ACTB-206ENST00000443528 H3BRJ5 948 aa16.03■□□□□ 0.16
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ACTB-206ENST00000443528 IL1BP01584 269 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CTSLP07711 333 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ZNF806P0C7X5 589 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 C5AR1P21730 350 aa16.03■□□□□ 0.16
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ACTB-206ENST00000443528 IL4RP24394 825 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 DRD3P35462 400 aa16.03■□□□□ 0.16
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ACTB-206ENST00000443528 HADHQ16836 314 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 RAD9BQ6WBX8 426 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 TMTC1Q8IUR5 882 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 TMEM139Q8IV31 216 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 NPWQ8N729 165 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 SPC24Q8NBT2 197 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 NETO2Q8NC67 525 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CHST14Q8NCH0 376 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CADM4Q8NFZ8 388 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 TSC1Q92574 1164 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 PIGKQ92643 395 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 HSPA12BQ96MM6 686 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CSPG4P5Q96PW8 444 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 NEUROG2Q9H2A3 272 aa16.03■□□□□ 0.16
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