RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 SV2CQ496J9 727 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 XKR4Q5GH76 650 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 PACS1Q6VY07 963 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 DTNBP1Q96EV8 351 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 IQCA1LA6NCM1 817 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 HSPA4LO95757 839 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 SERPINE1P05121 402 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 ARSAP15289 507 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 TPSB2P20231 275 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 RPL5P46777 297 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 PSEN2P49810 448 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 TPSAB1Q15661 275 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 LCA5Q86VQ0 697 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 ZFP42Q96MM3 310 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 COPG2Q9UBF2 871 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 MFSD11O43934 449 aa18.14■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 FBXO21O94952 628 aa18.14■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 MTTPP55157 894 aa18.14■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 FLOT2Q14254 428 aa18.14■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa18.14■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP18.14■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 31.7
TSPAN17-201ENST00000298564 AGAP3Q96P47 875 aa18.14■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 DUSP16Q9BY84 665 aa18.14■□□□□ 0.5
TSPAN17-201ENST00000298564 LTFP02788 710 aa18.14■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 NME3Q13232 169 aa18.14■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 SEMA5AQ13591 1074 aa18.14■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa18.14■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 SYPL2Q5VXT5 272 aa18.14■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 WSCD1Q658N2 575 aa18.14■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 NXNQ6DKJ4 435 aa18.14■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 LIMS2Q7Z4I7 341 aa18.14■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 SNX31Q8N9S9 440 aa18.14■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 ACVR1CQ8NER5 493 aa18.14■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 PKP2Q99959 881 aa18.14■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 CDK4P11802 303 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 SPRYD7Q5W111 196 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 PAQR9Q6ZVX9 377 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 HSPBAP1Q96EW2 488 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM165Q9HC07 324 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 A0A0A0MRY4 1105 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 UNCXA6NJT0 531 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 M0QYT0 321 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 TOMM70O94826 608 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 CPA3P15088 417 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC5A2P31639 672 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 RGS2P41220 211 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 HPCAP84074 193 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 CCL14Q16627 93 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 TP53INP2Q8IXH6 220 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 RCN3Q96D15 328 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 SPATA13Q96N96 652 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 AGAP2Q99490 1192 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 MOCS1Q9NZB8 636 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 A0A0J9YVX5 310 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 MEIS3P2A8K0S8 358 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 NPR3P17342 541 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 MPSTP25325 297 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 KIAA0319Q5VV43 1072 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 HFE2Q6ZVN8 426 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 CCNYQ8ND76 341 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 RNF139Q8WU17 664 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 ATP2A3Q93084 1043 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 CATSPER2Q96P56 530 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 NUF2Q9BZD4 464 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 LRRC4Q9HBW1 653 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 PTGESO14684 152 aa18.12■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 JUNP05412 331 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 WARSP23381 471 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 DPP6P42658 865 aa18.12■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 GLRBP48167 497 aa18.12■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 P2RY11Q96G91 374 aa18.12■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 MED10Q9BTT4 135 aa18.12■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 DNAI2Q9GZS0 605 aa18.12■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 TXNDC16Q9P2K2 825 aa18.12■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 FIS1Q9Y3D6 152 aa18.12■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 HAS3O00219 553 aa18.12■□□□□ 0.49
TSPAN17-201ENST00000298564 RNF103O00237 685 aa18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms