RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623935.1

SOX9-AS1-217, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 1,563 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-217ENST00000623935 C5orf60A6NFR6 353 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GFRA2O00451 464 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MATN3O15232 486 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MBTPS2O43462 519 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OPHN1O60890 802 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 UQCRHP07919 91 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CCNB1P14635 433 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PTGIRP43119 386 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SGSHP51688 502 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IL10RBQ08334 325 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FCHO2Q0JRZ9 810 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SERINC3Q13530 473 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CUL1Q13616 776 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PTK6Q13882 451 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DHCR24Q15392 516 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 EML3Q32P44 896 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MARC1Q5VT66 337 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FYB2Q5VWT5 728 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 AFMIDQ63HM1 303 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RETSATQ6NUM9 610 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 VITQ6UXI7 678 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PID1Q7Z2X4 250 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PCGF5Q86SE9 256 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TMEM25Q86YD3 366 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GLMNQ92990 594 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NXPE3Q969Y0 559 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ACDQ96AP0 544 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MYEOVQ96EZ4 313 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HMCESQ96FZ2 354 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 P2RY11Q96G91 374 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF599Q96NL3 588 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GUCD1Q96NT3 240 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KXD1Q9BQD3 176 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TRIM51Q9BSJ1 452 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TRIM31Q9BZY9 425 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KLC2Q9H0B6 622 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FAM114A2Q9NRY5 505 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TRHDEQ9UKU6 1024 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NUP205Q92621 2012 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DENND4AQ7Z401 1863 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 A0A0A0MRY4 1105 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 E7EVH7 732 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KCNK1O00180 336 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RNF103O00237 685 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CBX4O00257 560 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CHADO15335 359 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CTIFO43310 598 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KDELR3O43731 214 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MAFKO60675 156 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GCATO75600 419 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PENKP01210 267 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ITIH2P19823 946 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FCARP24071 287 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GDI1P31150 447 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 LMAN1P49257 510 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 VPS41P49754 854 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CAV1Q03135 178 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GPS1Q13098 491 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RUNX3Q13761 415 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PRPSAP1Q14558 356 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DMC1Q14565 340 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ELF2Q15723 593 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MAP9Q49MG5 647 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PARM1Q6UWI2 310 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NETO2Q8NC67 525 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RIN3Q8TB24 985 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IFT81Q8WYA0 676 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FGF14Q92915 247 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FATE1Q969F0 183 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 EXOC4Q96A65 974 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RTP4Q96DX8 246 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SNF8Q96H20 258 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SPATA13Q96N96 652 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 194.2 ms