RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 CUL4BQ13620 913 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 CBFBQ13951 182 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.57□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 GALNTL6Q49A17 601 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 ZNF569Q5MCW4 686 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 RINLQ6ZS11 566 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 ITPRIPQ8IWB1 547 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 RILPL2Q969X0 211 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 C3orf49Q96BT1 292 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 ZNF778Q96MU6 729 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 SH3BP4Q9P0V3 963 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.57□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 VPS4AQ9UN37 437 aa5.57□□□□□ -1.52
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TRDN-204ENST00000542443 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 BTBD19C9JJ37 291 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 FYB1O15117 783 aa5.56□□□□□ -1.52
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TRDN-204ENST00000542443 CYP3A4P08684 503 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 SERPINA4P29622 427 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 RPL15P61313 204 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 MFSD13AQ14CX5 517 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 RPS6KA2Q15349 733 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 TBRG1Q3YBR2 411 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 TMEM119Q4V9L6 283 aa5.56□□□□□ -1.52
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TRDN-204ENST00000542443 ANKRD40Q6AI12 368 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 HERC6Q8IVU3 1022 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 PDCL2Q8N4E4 241 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD44Q8N8A2 993 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 KIAA1524Q8TCG1 905 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
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TRDN-204ENST00000542443 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 G6PC2Q9NQR9 355 aa5.56□□□□□ -1.52
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TRDN-204ENST00000542443 FEM1BQ9UK73 627 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 LZTS1Q9Y250 596 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 AOX1Q06278 1338 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 EVC2Q86UK5 1308 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 DLC1Q96QB1 1528 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 CCDC189A1A4V9 331 aa5.55□□□□□ -1.52
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TRDN-204ENST00000542443 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 ADCK5Q3MIX3 580 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 CYP26C1Q6V0L0 522 aa5.55□□□□□ -1.52
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TRDN-204ENST00000542443 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 CCDC17Q96LX7 622 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
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TRDN-204ENST00000542443 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa5.55□□□□□ -1.52
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TRDN-204ENST00000542443 RAB21Q9UL25 225 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 KIF3AQ9Y496 699 aa5.55□□□□□ -1.52
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TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PP64 1363 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 DLG5Q8TDM6 1919 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 ATP7BP35670 1465 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 MLH3Q9UHC1 1453 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 E7EVH7 732 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 REC8O95072 547 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 CELA2AP08217 269 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 GAB1Q13480 694 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-204ENST00000542443 KCNB1Q14721 858 aa5.54□□□□□ -1.52
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