RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-231	ENST00000477334	RHOD	O00212	210 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	PEX12	O00623	359 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	KLK10	O43240	276 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	WNT1	P04628	370 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	MMP13	P45452	471 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	CCR5	P51681	352 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	MVD	P53602	400 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	MIDN	Q504T8	468 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	EME1	Q96AY2	570 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334		Q9N2J8	555 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	METTL18	O95568	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	FCGR2A	P12318	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	KLRC2	P26717	231 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	CHRNA5	P30532	468 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	STAT1	P42224	750 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	PMPCA	Q10713	525 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334		A0A1W2PPC1	479 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	NEURL1	O76050	574 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TNNT1	P13805	278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	CYP2J2	P51589	502 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	CHRND	Q07001	517 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ETFDH	Q16134	617 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TSPAN3	O60637	253 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	CBX6	O95503	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	AGR2	O95994	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	CD72	P21854	359 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	PRKCH	P24723	683 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms