RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa26.94■■□□□ 1.9
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C14orf80Q86SX3 495 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPY6RQ99463 290 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EBF2Q9HAK2 575 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIGVQ9NUD9 493 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa26.94■■□□□ 1.9
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR8D1Q8WZ84 308 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDCPQ9H6R7 721 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS28Q9UK41 221 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STAP1Q9ULZ2 295 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FHOD1Q9Y613 1164 aa26.93■■□□□ 1.9
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C10orf142B7Z368 130 aa26.92■■□□□ 1.9
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP11B1P15538 503 aa26.92■■□□□ 1.9
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXCR3P49682 368 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SULT1E1P49888 294 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDH4P55283 916 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNMA1Q12791 1236 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C5orf22Q49AR2 442 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRMS1LQ5PSV4 323 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C18orf8Q96DM3 657 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TKTL2Q9H0I9 626 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOR4AQ9NXH8 423 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR51B4Q9Y5P0 310 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D3EA0A087X179 549 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D3LB9A6J9 549 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADCY5O95622 1261 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D3HP0C7X1 549 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD38P28907 300 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DRD3P35462 400 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABRB2P47870 512 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL9RQ01113 521 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLG2Q15700 870 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INAVAQ3KP66 663 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM46CQ5VWP2 391 aa26.91■■□□□ 1.9
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUC3BQ9H195 1237 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1B0GTQ1 180 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA8CPA6NN73 597 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F9P00740 461 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WNT1P04628 370 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCNN1AP37088 669 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEUP1Q05D60 604 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAF3Q5VWG9 929 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERICH1Q86X53 443 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NT5C3BQ969T7 300 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERAC1Q96JX3 654 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNTN5O94779 1100 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF18P17022 549 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METAP1P53582 386 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q6ZVU0 165 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH2D3CQ8N5H7 860 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM131CQ96AQ9 280 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDM4CQ9H3R0 1056 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANLNQ9NQW6 1124 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM51Q9NW97 253 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SARDHQ9UL12 918 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM208BQ5VWN6 2430 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PR77 199 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLK4O00444 970 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WNT9AO14904 365 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALOX15BO15296 676 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC7A4O43246 635 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DKK1O94907 266 aa26.88■■□□□ 1.89
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