RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357179.9

TOP3B-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOP3B, Length 2,863 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-201ENST00000357179 HSPA1LP34931 641 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 SERPINB5P36952 375 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 ACMSDQ8TDX5 336 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 CALN1Q9BXU9 219 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 CXorf21Q9HAI6 301 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 NR1D2Q14995 579 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 FGD3Q5JSP0 725 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 CPXM1Q96SM3 734 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 OLFM1Q99784 485 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 NACA2Q9H009 215 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 MSCO60682 206 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 MCF2P10911 925 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 CNTFP26441 200 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 DPP6P42658 865 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 GALNT2Q10471 571 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 EMC1Q8N766 993 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 RNF148Q8N7C7 305 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 TERB1Q8NA31 727 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-201ENST00000357179 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 J3QRK9 145 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ERBB2P04626 1255 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 PRKCGP05129 697 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 CD19P15391 556 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TTKP33981 857 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 BNIP3Q12983 259 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 C4orf22Q6V702 233 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ILDR2Q71H61 639 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 FAM47BQ8NA70 645 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 MCUQ8NE86 351 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ATP6V1E2Q96A05 226 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 FBXL8Q96CD0 374 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 WNK4Q96J92 1243 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 SLC29A1Q99808 456 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 CDH19Q9H159 772 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 SDCBP2Q9H190 292 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 RAB6BQ9NRW1 208 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 KRBA1A5PL33 1030 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 CFAP99D6REC4 459 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 CFLARO15519 480 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 HOXC6P09630 235 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 RALBP11234 206 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TAF5Q15542 800 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 NHSL2Q5HYW2 709 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 BCO2Q9BYV7 579 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 H7C0C1 242 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 WNT10BO00744 389 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 B4GALT4O60513 344 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TNNC2P02585 160 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ATP5OP48047 213 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 NPNTQ6UXI9 565 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 SLC15A4Q8N697 577 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 MAPK15Q8TD08 544 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 RCN3Q96D15 328 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 OR52B2Q96RD2 323 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 WDR41Q9HAD4 459 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 COPG2Q9UBF2 871 aa14.95□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 NDUFB5O43674 189 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms