RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa-0.47□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A087WWL8 130 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 MOCS3O95396 460 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 TPOP07202 933 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNAI3P08754 354 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 NAGAP17050 411 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRDX5P30044 214 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 HOXD12P35452 270 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 LSSP48449 732 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIK3CGP48736 1102 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNAI1P63096 354 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 C2orf83Q53S99 150 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 FHL5Q5TD97 284 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 CACHD1Q5VU97 1274 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC4A10Q6U841 1118 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGFL2Q6UWQ7 119 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRIG3Q6UXM1 1119 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 OAFQ86UD1 273 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 DSELQ8IZU8 1212 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 METTL25Q8N6Q8 603 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 BICD2Q8TD16 824 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 NRG4Q8WWG1 115 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTC14Q96N46 770 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIGQQ9BRB3 760 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 MESP1Q9BRJ9 268 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLHL31Q9H511 634 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 NTN4Q9HB63 628 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC52A3Q9NQ40 469 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM36Q9NQ86 728 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLHL1Q9NR64 748 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASNSD1Q9NWL6 643 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRFN1Q9P244 771 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF175Q9Y473 711 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 DPPA5A6NC42 116 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPIPB5A8MRT5 1133 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 A8MVJ9 347 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPIPB4C9JG80 1138 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 CA12O43570 354 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 B4GALT2O60909 372 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB11FIP3O75154 756 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 NEURL1O76050 574 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 NTSR2O95665 410 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 MTHFD2P13995 350 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADRA1DP25100 572 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCTP40126 519 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 MTNR1BP49286 362 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 VPS41P49754 854 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 UCNP55089 124 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 TNFAIP2Q03169 654 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 TEFQ10587 303 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 MPEG1Q2M385 716 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 TOR2AQ5JU69 321 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 CERCAMQ5T4B2 595 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM71Q6P5X7 295 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 SOSTQ9BQB4 213 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 SENP7Q9BQF6 1050 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 EBF4Q9BQW3 602 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCF3Q9NUQ8 709 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF180Q9UJW8 692 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 INTUQ9ULD6 942 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 SHOC2Q9UQ13 582 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 EMSYQ7Z589 1322 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 DISP3Q9P2K9 1392 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRAG1Q86YV5 1406 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 DYTNA2CJ06 578 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 AGPSO00116 658 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 CAPN9O14815 690 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 MARCH6O60337 910 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 KDM4BO94953 1096 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 SGPL1O95470 568 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD5P06127 495 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00271P0C7V0 271 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 TYMPP19971 482 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPTP24298 496 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 MCM3P25205 808 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDUFS1P28331 727 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 TNFSF8P32971 234 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 PEX5P50542 639 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.7 ms